RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-30P01768 117 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-33P01772 117 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5AL1P0C617 328 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 GNG4P50150 75 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 BLOC1S1P78537 153 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC32Q5I0X7 151 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 LELP1Q5T871 98 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP82Q8N141 532 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 SYT8Q8NBV8 401 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 RYR1P21817 5038 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 F8WDY8 70 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 RHODO00212 210 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 CEBPGP53567 150 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB4BP61018 213 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2D3P61077 147 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2D2P62837 147 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 GTSF1Q8WW33 167 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM12Q96EX1 92 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM250H0YL14 139 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 P01737 135 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 NTF3P20783 257 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 EVI2AP22794 236 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 WFDC2Q14508 124 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF56Q15929 161 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX261Q6UWH6 196 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WTM6 91 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 C16orf90A8MZG2 172 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 M0QY20 66 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 CTRLP40313 264 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01551Q86U37 167 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 NIT1Q86X76 327 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 Q9HAA7 133 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 F5H697 171 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 GAS8-AS1O95177 125 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 MGPP08493 103 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 CNFNQ9BYD5 112 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF727A8MUV8 499 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 F2Z2F3 143 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 CACNG7P62955 275 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 NFE4Q86UQ8 179 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 GATD1Q8NB37 220 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 AP1S3Q96PC3 154 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 BIN3Q9NQY0 253 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK12Q9UKR0 248 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 V9GYV3 84 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 FAT1Q14517 4588 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 K7EP13 123 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM17P0DL12 118 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP10-1P60331 282 aa4.64□□□□□ -1.67
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