RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 LRCOL1A6NCL2 159 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP5-208ENST00000459627 CDK2AP2O75956 126 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP5-208ENST00000459627 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP5-208ENST00000459627 CACNG7P62955 275 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM250H0YL14 139 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP5-208ENST00000459627 NTF3P20783 257 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP5-208ENST00000459627 WFDC2Q14508 124 aa15.92■□□□□ 0.14
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SH3BP5-208ENST00000459627 F2Z2F3 143 aa15.9■□□□□ 0.14
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SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP10-1P60331 282 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BP5-208ENST00000459627 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa15.9■□□□□ 0.14
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SH3BP5-208ENST00000459627 BAALCQ8WXS3 180 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP5-208ENST00000459627 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa15.84■□□□□ 0.13
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SH3BP5-208ENST00000459627 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP5-208ENST00000459627 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa15.83■□□□□ 0.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 A8MWL6 223 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP5-208ENST00000459627 TEX261Q6UWH6 196 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP5-208ENST00000459627 RMI2Q96E14 147 aa15.78■□□□□ 0.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 LINC01620Q4KN68 170 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 CT83Q5H943 113 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 SMIM15Q7Z3B0 74 aa15.73■□□□□ 0.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 COX11Q9Y6N1 276 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 HIGD1CA8MV81 97 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 RPL23P62829 140 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM241Q24JQ0 296 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TSKUQ8WUA8 353 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM243Q9BU79 118 aa15.72■□□□□ 0.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 GAS8-AS1O95177 125 aa15.71■□□□□ 0.11
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