RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 AQP10Q96PS8 301 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-211ENST00000449757 DERL1Q9BUN8 251 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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DDX39B-211ENST00000449757 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-211ENST00000449757 ALG5Q9Y673 324 aa6.59□□□□□ -1.35
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DDX39B-211ENST00000449757 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.58□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 SMIM17P0DL12 118 aa6.58□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.57□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 RAB5CP51148 216 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 REG3AQ06141 175 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.57□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 RNF213Q63HN8 5207 aa6.57□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.56□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 PRR34Q9NV39 138 aa6.56□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.55□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 AP1S3Q96PC3 154 aa6.55□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 WDR73Q6P4I2 378 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 GTSF1Q8WW33 167 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 RNF185Q96GF1 192 aa6.54□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 TPPP3Q9BW30 176 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 VAX2Q9UIW0 290 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2L6O14933 153 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 SNAI2O43623 268 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 PAGE4O60829 102 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 SULT1A2P50226 295 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-211ENST00000449757 ODF1Q14990 250 aa6.53□□□□□ -1.36
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DDX39B-211ENST00000449757 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 PFDN1O60925 122 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 P01737 135 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 CXCL1P09341 107 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 OR5AL1P0C617 328 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 FHITP49789 147 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 BAGE2Q86Y30 109 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.51□□□□□ -1.37
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DDX39B-211ENST00000449757 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 COX6A2Q02221 97 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 SLPIP03973 132 aa6.5□□□□□ -1.37
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DDX39B-211ENST00000449757 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 M0QY20 66 aa6.49□□□□□ -1.37
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DDX39B-211ENST00000449757 GZMBP10144 247 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 AMTP48728 403 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 CFAP161Q6P656 301 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 STPG4Q8N801 248 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 C15orf56Q8N910 161 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 LINC01600Q96MT4 127 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GUV1 79 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 ARPC5O15511 151 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 COTL1Q14019 142 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 RASL11AQ6T310 242 aa6.47□□□□□ -1.37
DDX39B-211ENST00000449757 REG3GQ6UW15 175 aa6.47□□□□□ -1.37
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