RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-206ENST00000431413 Q6ZSA8 131 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-206ENST00000431413 AP1S3Q96PC3 154 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-206ENST00000431413 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-206ENST00000431413 GNG13Q9P2W3 67 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-206ENST00000431413 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-206ENST00000431413 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-206ENST00000431413 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-206ENST00000431413 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-206ENST00000431413 SSTP61278 116 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-206ENST00000431413 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 C11orf52Q96A22 123 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 HERC1Q15751 4861 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 XKRY2A2RUG3 117 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 H7C1H1 209 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 MPV17L2Q567V2 206 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 SMIM12Q96EX1 92 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 DERL1Q9BUN8 251 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 TPPP3Q9BW30 176 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 VAX2Q9UIW0 290 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 IFNA1P01562 189 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 GNG4P50150 75 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 CCL20P78556 96 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 MIAQ16674 131 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 CENPWQ5EE01 88 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 ENHOQ6UWT2 76 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 BIN3Q9NQY0 253 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 PDE6DO43924 150 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 CACNG7P62955 275 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 LINC01620Q4KN68 170 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 F2Z2F3 143 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 P01737 135 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 MGPP08493 103 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 J3QL48 77 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 IGLC6P0CF74 106 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 SULT1A2P50226 295 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 SCXQ7RTU7 201 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 MED9Q9NWA0 146 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 RAB19A4D1S5 217 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 M0QY20 66 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 IGLV2-8P01709 118 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 HLA-DQA1P01909 254 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 TRGC1P0CF51 173 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 GZMBP10144 247 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 IQCJQ1A5X6 159 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-206ENST00000431413 MYCBP2O75592 4640 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 USP17L23D6RBM5 183 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 RBX1P62877 108 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 GAGE6Q13070 117 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 PRR34Q9NV39 138 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 BCL2P10415 239 aa9.88□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.88□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 SLC51BQ86UW2 128 aa9.88□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 RASL11AQ6T310 242 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 NTF3P20783 257 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 WDR73Q6P4I2 378 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 TMEM243Q9BU79 118 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 NIT2Q9NQR4 276 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 REG3AQ06141 175 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 A0A1B0GUV1 79 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 UBE2L6O14933 153 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 PRSS1P07477 247 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 NUDT11Q96G61 164 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HERC3-206ENST00000431413 COTL1Q14019 142 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-206ENST00000431413 TWIST1Q15672 202 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-206ENST00000431413 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-206ENST00000431413 CTRLP40313 264 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-206ENST00000431413 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92 ms