RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410678.1

RNU6-402P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 402, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-402P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-402P-201ENST00000410678 SPCS3P61009 180 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 SDHAF4Q5VUM1 108 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 NDUFA12Q9UI09 145 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-3.66□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 PIK3C2AO00443 1686 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 MYH1P12882 1939 aa-3.66□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 SSNA1O43805 119 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 TRGC2P03986 189 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 PET100P0DJ07 73 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCL2P13500 99 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 FGF7P21781 194 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 LCN1P31025 176 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 BLVRAP53004 296 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 MAXP61244 160 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 NDUFA11Q86Y39 141 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 MORN4Q8NDC4 146 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 NCAPD3P42695 1498 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 DLC1Q96QB1 1528 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 WDR97A6NE52 1622 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCL18P55774 89 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 BLCAPP62952 87 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 Q8N8P6 123 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 OTOSQ8NHW6 89 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 MGAQ8IWI9 3026 aa-3.68□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 CHP2O43745 196 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 BANF1O75531 89 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 OMPP47874 163 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 SLC25A26Q70HW3 274 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 AKAP14Q86UN6 197 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 OTUD6BQ8N6M0 293 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 OR5H6Q8NGV6 325 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 C8orf76Q96K31 380 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 MCEEQ96PE7 176 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 SPRR4Q96PI1 79 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 ABCC11Q96J66 1382 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP-3.7□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 CKS2P33552 79 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 WFDC9Q8NEX5 89 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 AP3S1Q92572 193 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 CSMD2Q7Z408 3487 aa-3.7□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-3.71□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP-3.71□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 IFNA7P01567 189 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 TNNC2P02585 160 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 COTL1Q14019 142 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-3.71□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 CD109Q6YHK3 1445 aa-3.71□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-3.72□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 F8VZ95 297 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-3.72□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 UBE2D1P51668 147 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 MED21Q13503 144 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 C10orf82Q8WW14 230 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 PHB2Q99623 299 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 LRTM1Q9HBL6 345 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-402P-201ENST00000410678 PRDM2Q13029 1718 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 PARVBQ9HBI1 364 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 STOML2Q9UJZ1 356 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 FREM2Q5SZK8 3169 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 PDE6DO43924 150 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 IFNA14P01570 189 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 OR2J1Q9GZK6 312 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 IL20Q9NYY1 176 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 ARHGEF5Q12774 1597 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 I3L3M4 83 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 CSTAP01040 98 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 PIRTP0C851 137 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 CARD18P57730 90 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 NEK7Q8TDX7 302 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 AIPO00170 330 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 YPEL1O60688 119 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 PPP1R17O96001 155 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 COX5BP10606 129 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 FABP2P12104 132 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 S100A5P33763 92 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 COX17Q14061 63 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 BORCS7Q96B45 105 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-402P-201ENST00000410678 R4GMQ9 66 aa-3.76□□□□□ -3.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms