RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 MED14OSP0DP75 135 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 ENHOQ6UWT2 76 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZQT7 251 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 RNF185Q96GF1 192 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 NCR3O14931 201 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 COX7CP15954 63 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 NCKAP5O14513 1909 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-30P01768 117 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 SERP2Q8N6R1 65 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 MDFICQ9P1T7 246 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 MP68P56378 58 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 IMUPQ9GZP8 106 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 TMEM223A0PJW6 202 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 MSMBP08118 114 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 AJUBAQ96IF1 538 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 USP17L23D6RBM5 183 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 MYCNOSP40205 109 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 LY6DQ14210 128 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 K7EQD1 137 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 SLPIP03973 132 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 NDUFS5O43920 106 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 H3BUA1 57 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 DSCR9P59020 149 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZS46 218 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 IGLV1-47P01700 117 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 IGLV2-11P01706 119 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 Q8N9W7 124 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 GAS8-AS1O95177 125 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 Q6Q795 121 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 SCXQ7RTU7 201 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 MSMPQ1L6U9 139 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 SPRY4Q9C004 299 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 Q8N7P7 452 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 SNURFQ9Y675 71 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 DEFB136Q30KP8 78 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 C1orf195Q5TG92 126 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 H7C423 109 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 PSCAO43653 123 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 IGF1P05019 195 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 LST1O00453 97 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 CGB3P0DN86 165 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 CGB7P0DN87 165 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 A8MZ25 164 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 GATA3P23771 443 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 BLCAPP62952 87 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 ELANEP08246 267 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 TIRAPP58753 221 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 UBE2BP63146 152 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 NRACQ8N912 160 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 TIMM17BO60830 172 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC3-202ENST00000402738 GYPEP15421 78 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 PDE6GP18545 87 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 H3BQ85 93 aa7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms