RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 M0QY20 66 aa20.66■□□□□ 0.9
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PKDCC-202ENST00000401498 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa20.66■□□□□ 0.9
PKDCC-202ENST00000401498 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa20.65■□□□□ 0.9
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PKDCC-202ENST00000401498 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa20.64■□□□□ 0.9
PKDCC-202ENST00000401498 TIRAPP58753 221 aa20.64■□□□□ 0.9
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PKDCC-202ENST00000401498 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
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PKDCC-202ENST00000401498 UBE2D2P62837 147 aa20.62■□□□□ 0.89
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PKDCC-202ENST00000401498 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa20.6■□□□□ 0.89
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa20.59■□□□□ 0.89
PKDCC-202ENST00000401498 M0R2N4 97 aa20.59■□□□□ 0.89
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PKDCC-202ENST00000401498 LELP1Q5T871 98 aa20.56■□□□□ 0.88
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PKDCC-202ENST00000401498 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa20.55■□□□□ 0.88
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PKDCC-202ENST00000401498 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa20.54■□□□□ 0.88
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PKDCC-202ENST00000401498 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa20.45■□□□□ 0.86
PKDCC-202ENST00000401498 RPS10P46783 165 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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PKDCC-202ENST00000401498 SMKR1H3BMG3 65 aa20.43■□□□□ 0.86
PKDCC-202ENST00000401498 NCR2O95944 276 aa20.42■□□□□ 0.86
PKDCC-202ENST00000401498 LINC01556Q5JQF7 62 aa20.42■□□□□ 0.86
PKDCC-202ENST00000401498 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa20.42■□□□□ 0.86
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PKDCC-202ENST00000401498 IGHV3-30P01768 117 aa20.38■□□□□ 0.85
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PKDCC-202ENST00000401498 K7EP13 123 aa20.38■□□□□ 0.85
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PKDCC-202ENST00000401498 ST20Q9HBF5 79 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 RTL8CO15255 209 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 CKS2P33552 79 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 IQCJQ1A5X6 159 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 GNB1LQ9BYB4 327 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 COX19Q49B96 90 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 C6orf223Q8N319 242 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM70Q9BUB7 260 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-202ENST00000401498 DNAH17Q9UFH2 4485 aa20.34■□□□□ 0.85
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