RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 I3L2K1 104 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV12-3P01733 135 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 PRAC2D3DTV9 90 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 ODF1Q14990 250 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 CASC2Q6XLA1 102 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 B9D2Q9BPU9 175 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 E7EUB6 86 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 Q8N1Y9 231 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 DAND5Q8N907 189 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 MED12LQ86YW9 2145 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS33Q8NF86 280 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 MED14OSP0DP75 135 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 P0C879 139 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 CTSGP08311 255 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 SPAG11BQ08648 103 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf86A6NJI1 115 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM89A2RUT3 159 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 H0Y9J4 135 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 MSMPQ1L6U9 139 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 RNF183Q96D59 192 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 WISP2O76076 250 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00643Q86TS7 51 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 E9PLD3 99 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 LECT2O14960 151 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB1P60022 68 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 RBX1P62877 108 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 K7EMT4 169 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV2-8P01709 118 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV4-1P06312 121 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 USP17L23D6RBM5 183 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 CLEC2BQ92478 149 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 COX7BP24311 80 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 MYCNOSP40205 109 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 YPEL4Q96NS1 127 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 V9GYY9 64 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 PTPRSQ13332 1948 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GXF2 115 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 PRR15LQ9BU68 103 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 PRO3102Q9H379 93 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 BPY2O14599 106 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-30P01768 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-33P01772 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 CRYGBP07316 175 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 UPK3BQ9BT76 320 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 MT-ATP8P03928 68 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV2-23P01705 113 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 INSL3P51460 131 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 F8W735 103 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 LGALS9O00182 355 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 CTRLP40313 264 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV4-59P01825 116 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZUT4 128 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 NPBQ8NG41 125 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 TCL1BO95988 128 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 TOMM6Q96B49 74 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 NCKAP5O14513 1909 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 TEX22C9J3V5 150 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 BRK1Q8WUW1 75 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV1-47P01700 117 aa6.79□□□□□ -1.32
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