RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 CT83Q5H943 113 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 NIT1Q86X76 327 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 FRZBQ92765 325 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 Q9UF83 564 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.71□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 NTF3P20783 257 aa5.71□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 CTRLP40313 264 aa5.71□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 Q0VG73 95 aa5.71□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 TEX261Q6UWH6 196 aa5.71□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.71□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.71□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM231BA6NCW3 169 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF727A8MUV8 499 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 K7EN84 100 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 M0QY20 66 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 KRTAP10-2P60368 255 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 SSTP61278 116 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 TWIST1Q15672 202 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 RASL11AQ6T310 242 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 Q9HAA7 133 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 NIT2Q9NQR4 276 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 HERC2O95714 4834 aa5.7□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM262E9PQX1 116 aa5.69□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 MGPP08493 103 aa5.69□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 CEBPGP53567 150 aa5.69□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 PEA15Q15121 130 aa5.69□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.69□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.69□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 BORCS7Q96B45 105 aa5.69□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.69□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 OSTCQ9NRP0 149 aa5.69□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.68□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.68□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.68□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 IQCJQ1A5X6 159 aa5.68□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.68□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC01551Q86U37 167 aa5.68□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 TSKUQ8WUA8 353 aa5.68□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.68□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 KLK12Q9UKR0 248 aa5.68□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.67□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1B0GUT8 65 aa5.67□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 CRPP02741 224 aa5.67□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 GCSHP23434 173 aa5.67□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.67□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8N976 141 aa5.67□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 GTSF1Q8WW33 167 aa5.67□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2WQ96B02 151 aa5.67□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.66□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.66□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1B0GUV1 79 aa5.66□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 MIAQ16674 131 aa5.66□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 C14orf177Q52M58 125 aa5.66□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8N3U1 123 aa5.66□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8N814 137 aa5.66□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 NAT8Q9UHE5 227 aa5.66□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 HIGD1CA8MV81 97 aa5.65□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 NCR2O95944 276 aa5.65□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB14P61106 215 aa5.65□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 RIGQ13278 110 aa5.65□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 COTL1Q14019 142 aa5.65□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.65□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM243Q9BU79 118 aa5.65□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.65□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.65□□□□□ -1.5
MT-TS1-201ENST00000387416 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1B0GW15 77 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 H7C423 109 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2L6O14933 153 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1R17O96001 155 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 RBX1P62877 108 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 MPV17L2Q567V2 206 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 GATD1Q8NB37 220 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 ISOC2Q96AB3 205 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 PRR34Q9NV39 138 aa5.64□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.63□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.63□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 S100A8P05109 93 aa5.63□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 AMTP48728 403 aa5.63□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 GAGE6Q13070 117 aa5.63□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 ADIRFQ15847 76 aa5.63□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 ENHOQ6UWT2 76 aa5.63□□□□□ -1.51
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8N1X5 172 aa5.63□□□□□ -1.51
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