RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 GINS2Q9Y248 185 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0D9SFI3 127 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 EDDM3BP56851 147 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 HSPB11Q9Y547 144 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 PARP14Q460N5 1801 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 WFDC6Q9BQY6 131 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYNJ1O43426 1573 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 NBEAP1P0C6P0 100 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q5VSD8 79 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 C10orf82Q8WW14 230 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 RYR3Q15413 4870 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 S100A5P33763 92 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL6A3P12111 3177 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIN1P1O15428 100 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIRTP0C851 137 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBE2D1P51668 147 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPAG11BQ08648 103 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 USH2AO75445 5202 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0R129 80 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPRR1AP35321 89 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 NCS1P62166 190 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC153Q494R4 210 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q5VV11 94 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPRMQ9NS64 109 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACANP16112 2415 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 MORN2Q502X0 79 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPANXCQ9NY87 97 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-227P-201ENST00000362865 USF3Q68DE3 2245 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDZD2O15018 2839 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATRQ13535 2644 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 H0YJX3 145 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 DBIP07108 87 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBE2G1P62253 170 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q8IZM0 81 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 SELENOSQ9BQE4 189 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 SAR1AQ9NR31 198 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPTA1P02549 2419 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 PITX3O75364 302 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 BAGE3Q86Y29 109 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 HERC1Q15751 4861 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM92AA1XBS5 289 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFNA17P01571 189 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLC6P0CF74 106 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 MMGT1Q8N4V1 131 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPANXA1Q9NS26 97 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF609O15014 1411 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 HERC2O95714 4834 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 A6NIN4 97 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCE1O60756 84 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 MT4P47944 62 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADGRB1O14514 1584 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 RYR1P21817 5038 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLXNB2O15031 1838 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 LAMC1P11047 1609 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 OVOS2Q6IE36 1432 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMIM6P0DI80 62 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.77□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms