RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 MED14OSP0DP75 135 aa16.02■□□□□ 0.15
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SMURF1-201ENST00000361125 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa16.01■□□□□ 0.15
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SMURF1-201ENST00000361125 ODF1Q14990 250 aa16.01■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 hADV29S1A0JD25 119 aa16.01■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 NCR3O14931 201 aa16.01■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 Q6YL49 198 aa16■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 MED13LQ71F56 2210 aa16■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 VSIG2Q96IQ7 327 aa16■□□□□ 0.15
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SMURF1-201ENST00000361125 TIRAPP58753 221 aa15.99■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa15.99■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.99■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 A4D1N5 150 aa15.99■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 WFDC2Q14508 124 aa15.98■□□□□ 0.15
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SMURF1-201ENST00000361125 FAM231CP0DMU5 169 aa15.98■□□□□ 0.15
SMURF1-201ENST00000361125 MLST8Q9BVC4 326 aa15.97■□□□□ 0.15
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SMURF1-201ENST00000361125 E9PLD3 99 aa15.95■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 C11orf86A6NJI1 115 aa15.94■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD29Q8N6D5 301 aa15.94■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 CRYBA4P53673 196 aa15.94■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 TP73-AS1Q9UF72 201 aa15.94■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF843Q8N446 348 aa15.93■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 TIMM17AQ99595 171 aa15.93■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 INAFM1C9JVW0 142 aa15.93■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 IGF1P05019 195 aa15.93■□□□□ 0.14
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SMURF1-201ENST00000361125 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.93■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.93■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 NOTCH3Q9UM47 2321 aa15.92■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.92■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 NDUFS5O43920 106 aa15.92■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 LY6LH3BQJ8 138 aa15.91■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 NDUFA1O15239 70 aa15.91■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 INSL3P51460 131 aa15.91■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.91■□□□□ 0.14
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SMURF1-201ENST00000361125 Q6ZTI0 123 aa15.9■□□□□ 0.14
SMURF1-201ENST00000361125 Q6ZUT4 128 aa15.89■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.89■□□□□ 0.13
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SMURF1-201ENST00000361125 TEN1Q86WV5 123 aa15.88■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 TRACP01848 142 aa15.88■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 CEP192Q8TEP8 1941 aa15.87■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 LGALS9O00182 355 aa15.87■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 IGLC6P0CF74 106 aa15.87■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.87■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 MED12LQ86YW9 2145 aa15.86■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 FOXI1Q12951 378 aa15.86■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.85■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 NFE4Q86UQ8 179 aa15.85■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa15.85■□□□□ 0.13
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SMURF1-201ENST00000361125 FSTL3O95633 263 aa15.85■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa15.85■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 C10orf142B7Z368 130 aa15.84■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 LINC01620Q4KN68 170 aa15.84■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 H0YGX0 51 aa15.84■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 PKIGQ9Y2B9 76 aa15.84■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 Q6ZSV7 163 aa15.84■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 CLEC2BQ92478 149 aa15.84■□□□□ 0.13
SMURF1-201ENST00000361125 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.83■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.83■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 CRIP1P50238 77 aa15.83■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 EBI3Q14213 229 aa15.83■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 FAM208BQ5VWN6 2430 aa15.82■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 B5MCH6 92 aa15.81■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.81■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 UBE2AP49459 152 aa15.81■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.81■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.81■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 ODF3Q96PU9 254 aa15.8■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa15.8■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 TM2D2Q9BX73 214 aa15.8■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 SS18L2Q9UHA2 77 aa15.8■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 CXCL5P42830 114 aa15.8■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.8■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 ACYP1P07311 99 aa15.79■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 CDSNQ15517 529 aa15.79■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 LECT2O14960 151 aa15.79■□□□□ 0.12
SMURF1-201ENST00000361125 FAM110AQ9BQ89 295 aa15.79■□□□□ 0.12
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