RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293604.10

C6orf136-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf136, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-201ENST00000293604 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
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C6orf136-201ENST00000293604 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa16.11■□□□□ 0.17
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C6orf136-201ENST00000293604 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.06■□□□□ 0.16
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C6orf136-201ENST00000293604 TLN2Q9Y4G6 2542 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 ARL17AQ8IVW1 177 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 CFC1BP0CG36 223 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 CFC1P0CG37 223 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 PSMB2P49721 201 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 FOXI1Q12951 378 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-201ENST00000293604 P0DMU3 169 aa16.02■□□□□ 0.15
C6orf136-201ENST00000293604 FAM231AP0DMU4 169 aa16.02■□□□□ 0.15
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