RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-30P01768 117 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-33P01772 117 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 YPEL4Q96NS1 127 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 A0A096LPF7 62 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 COX17Q14061 63 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01548A6NM66 108 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV1-40P01703 118 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 G3V4G9 280 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 FXYD2P54710 66 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFC2O95298 119 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 TDRG1Q3Y452 100 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.79□□□□□ -1.32
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PTPRB-201ENST00000261266 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 PI4KAP42356 2102 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 PROP1O75360 226 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZPA2 131 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 CNFNQ9BYD5 112 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 REG3AQ06141 175 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF702PQ9H963 129 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 SPTBP11277 2137 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 J3KT08 172 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf85Q96MD7 179 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 M0QY20 66 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 NCR3O14931 201 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZUT4 128 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 KLLNB2CW77 178 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV12-3P01733 135 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 Q9HAA7 133 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 SPTA1P02549 2419 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 RNF185Q96GF1 192 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 ALPK3Q96L96 1907 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 LECT2O14960 151 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF843Q8N446 348 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 C20orf173Q96LM9 149 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 LRP4O75096 1905 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRB-201ENST00000261266 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRB-201ENST00000261266 IGLV2-11P01706 119 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 IMUPQ9GZP8 106 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFS5O43920 106 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZSV7 163 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 C16orf95Q9H693 158 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 KLK12Q9UKR0 248 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 CACNA1EQ15878 2313 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 C19orf84I3L1E1 186 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 LELP1Q5T871 98 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 MPDZO75970 2070 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFC1O43677 76 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 SVILO95425 2214 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZTI0 123 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 UPK3BQ9BT76 320 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 M0R378 163 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 TCL1BO95988 128 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 CRYGDP07320 174 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 NRACQ8N912 160 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 MRAPQ8TCY5 172 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 TSHBP01222 138 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-201ENST00000261266 PRB1P04280 392 aa6.7□□□□□ -1.34
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