RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 APOC4P55056 127 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 CACNA1HO95180 2353 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 NACAE9PAV3 2078 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 NCR3O14931 201 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-30P01768 117 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 TMEM223A0PJW6 202 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 MSMBP08118 114 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 TANC1Q9C0D5 1861 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 ZGRF1Q86YA3 2104 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 RMI2Q96E14 147 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 DYSFO75923 2080 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 CRIP3Q6Q6R5 217 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 NDUFC1O43677 76 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 DSCAML1Q8TD84 2053 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZQT7 251 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 PROP1O75360 226 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 C20orf173Q96LM9 149 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 USF3Q68DE3 2245 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 U3KQA8 63 aa12.24□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 GTF3C1Q12789 2109 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 RNF185Q96GF1 192 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 ELANEP08246 267 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 TIMM17BO60830 172 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 DIRC1Q969H9 104 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 COL4A3Q01955 1670 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 WT1P19544 449 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 UBE2BP63146 152 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 LST1O00453 97 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 BPY2O14599 106 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 CRIP1P50238 77 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 LINC00308Q8TCZ7 52 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 AJUBAQ96IF1 538 aa12.21□□□□□ -0.45
CTIF-201ENST00000256413 DEFB113Q30KQ7 82 aa12.21□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 SMIM26A0A096LP01 95 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 MYCNOSP40205 109 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 DEFB1P60022 68 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 MED13Q9UHV7 2174 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 FAM215AQ9Y5M1 114 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.2□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 NDUFB1O75438 58 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 PLA2G2CQ5R387 149 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 CAMK2N2Q96S95 79 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 SNURFQ9Y675 71 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 COL4A6Q14031 1691 aa12.19□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 H7C423 109 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 BLCAPP62952 87 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 Q8N9W7 124 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 SLPIP03973 132 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 CGB3P0DN86 165 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 IGFL3Q6UXB1 125 aa12.18□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 IGLV1-47P01700 117 aa12.17□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.17□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.17□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 TIRAPP58753 221 aa12.17□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 FRMPD3Q5JV73 1810 aa12.17□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.17□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 APRG1Q8IVJ8 170 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 DENND4CQ5VZ89 1909 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 VPREB3Q9UKI3 123 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 SCXQ7RTU7 201 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 GYPEP15421 78 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 ALPK3Q96L96 1907 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 CACNA1BQ00975 2339 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 SPRY4Q9C004 299 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 NDUFA1O15239 70 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 C16orf74Q96GX8 76 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-201ENST00000256413 COX7BP24311 80 aa12.15□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 Q6JHZ5 121 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZS46 218 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 IGLV2-11P01706 119 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 SERP1Q9Y6X1 66 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 NCKAP5O14513 1909 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 K7EMT4 169 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 PIP4P1Q86T03 277 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 CGB7P0DN87 165 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.13□□□□□ -0.47
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