RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC01545Q5VT33 79 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
APOBEC1-201ENST00000229304 VAMP8Q9BV40 100 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC1-201ENST00000229304 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC1-201ENST00000229304 AGRNO00468 2067 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC01549A6NIU2 74 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP5LO75964 103 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 AZU1P20160 251 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF56Q15929 161 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 CSTL1Q9H114 145 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 TCAPO15273 167 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 PRM2P04554 102 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 C16orf74Q96GX8 76 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 MUC4Q99102 2169 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 CIDEAO60543 219 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 NUDT3O95989 172 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 TOMM6Q96B49 74 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 KIR2DL4Q99706 377 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 PRO1933Q9H354 126 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV3-53P01767 116 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 DDTP30046 118 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 RIPPLY3P57055 190 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 RHOHQ15669 191 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 RRN3P1Q2M238 152 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 LCE4AQ5TA78 99 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00587B1AMM8 73 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLL1P15814 213 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA45Q537H7 98 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 ATRQ13535 2644 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 I3L3M4 83 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 C3orf56Q8N813 242 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 ZMAT4Q9H898 229 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC1-201ENST00000229304 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 PRSS1P07477 247 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLC3P0DOY3 106 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 APOC4P55056 127 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 ODF1Q14990 250 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZSN1 163 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 ERASQ7Z444 233 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 ATOH7Q8N100 152 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 C18orf15Q96N68 181 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A087WX48 190 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 IGIPA6NJ69 53 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 H0Y8G0 127 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 TSHBP01222 138 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZTI0 123 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM141Q96I45 108 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 TIMM17AQ99595 171 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFA6Q01524 100 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 MAJINQ3KP22 176 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZN92 141 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.81□□□□□ -1.32
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