RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 DEFB124Q8NES8 71 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 SPANXCQ9NY87 97 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 H3BT86 120 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 GNRH2O43555 120 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 SPRY2O43597 315 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 H3BMM0 161 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 TRIAP1O43715 76 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 ECSCRQ19T08 205 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 UBE2WQ96B02 151 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 TGFAP01135 160 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 EMP1P54849 157 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 C9orf85Q96MD7 179 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 A0A0J9YXY3 114 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 ABCA1O95477 2261 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 NDUFA4O00483 81 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 FAM104AQ969W3 186 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 H7C423 109 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 G3V318 75 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 UBE2E1P51965 193 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 TCF15Q12870 199 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 TTC32Q5I0X7 151 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 M0QY20 66 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 LY6DQ14210 128 aa7.34□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.34□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.34□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.34□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.34□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.34□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 LST1O00453 97 aa7.34□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.34□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.34□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 LINC01587Q99440 93 aa7.34□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 JPT2Q9H910 190 aa7.33□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.33□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 RNF152Q8N8N0 203 aa7.33□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.33□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 TIMM17BO60830 172 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 ARL3P36405 182 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 H3BUA1 57 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 LY6HO94772 140 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 MIAQ16674 131 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 IMUPQ9GZP8 106 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 TMEM126AQ9H061 195 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 J3KRW8 73 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 DEFB1P60022 68 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 C2orf82Q6UX34 121 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 LINC01560Q8TB33 94 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 IGHV4-39P01824 125 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 HERV-K104P63124 156 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 FOXC1Q12948 553 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 ZNF580Q9UK33 172 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 F6UB75 175 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 SAA4P35542 130 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WWL8 130 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 A0A0J9YXV3 536 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 I3L3M4 83 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 TRBV12-3P01733 135 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 ACYP1P07311 99 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 DCANP1Q8TF63 244 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 USMG5Q96IX5 58 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-242ENST00000602319 Q1RN00 199 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms