RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RASL10A	Q92737	203 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SRR	Q9GZT4	340 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF492	Q9P255	531 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		Q9UF83	564 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	NAGK	Q9UJ70	344 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	HSPB11	Q9Y547	144 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	ALG5	Q9Y673	324 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1B0GV90	55 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	IGSF23	A1L1A6	192 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	FABP12	A6NFH5	140 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		F6UZH7	168 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RS1	O15537	224 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	GNRH2	O43555	120 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CST7	O76096	145 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	IGLV2-11	P01706	119 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TYMS	P04818	313 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PRSS1	P07477	247 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	NMB	P08949	121 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	OR10J4	P0C629	311 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	LINC00614	P0C842	121 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	LINC00694	P0DN24	101 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	BTC	P35070	178 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF138	P52744	262 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RAB5B	P61020	215 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	BAX	Q07812	192 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PDE6H	Q13956	83 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF266	Q14584	549 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	VWC2	Q2TAL6	325 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	LELP1	Q5T871	98 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		Q6AWC8	147 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	S100A7A	Q86SG5	101 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	FXYD5	Q96DB9	178 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	GGACT	Q9BVM4	153 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF24	Q9Y225	148 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	MUC17	Q685J3	4493 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	C5orf51	A6NDU8	294 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		M0R2P5	195 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	NDUFB6	O95139	128 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	FGF7	P21781	194 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	G0S2	P27469	103 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TAS2R30	P59541	319 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RAB2A	P61019	212 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RHOH	Q15669	191 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TDRG1	Q3Y452	100 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PYDC2	Q56P42	97 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		Q6ZRG5	221 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	STOML3	Q8TAV4	291 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TVP23C	Q96ET8	276 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SPX	Q9BT56	116 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TREM1	Q9NP99	234 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF222	A6NCQ9	220 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	IFITM10	A6NMD0	228 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	TSTD3	H0UI37	97 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	TEX46	H3BTG2	121 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	RAB5C	P51148	216 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	CEBPG	P53567	150 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	AP3S2	P59780	193 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	PKIA	P61925	76 aa		2.52	□□□□□ -2.01
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		2.52	□□□□□ -2.01

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