RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567947.1

CBFB-208, Transcript of core-binding factor subunit beta, human

TSL 3

Gene CBFB, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBFB-208	ENST00000567947	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	CARD19	Q96LW7	228 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TRGV9	Q99603	122 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	FZR1	Q9UM11	496 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	C5orf63	A6NC05	138 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	C17orf98	A8MV24	154 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947		C9JAW5	83 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	CCDC179	H3BU77	68 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	ORM1	P02763	201 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	CRYGD	P07320	174 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	B4GALT1	P15291	398 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	IGHV1-2	P23083	117 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	HLA-DMB	P28068	263 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	CFHR2	P36980	270 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	CXCL5	P42830	114 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	INSL3	P51460	131 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	ATP5J2	P56134	94 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947		Q6ZR03	302 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TMEM101	Q96IK0	257 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	LINC01587	Q99440	93 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	PAXX	Q9BUH6	204 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	STAB1	Q9NY15	2570 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947		H3BT86	120 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	NPFF	O15130	113 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	SCGB2A1	O75556	95 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TSHB	P01222	138 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	CRYGA	P11844	174 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	SLC25A16	P16260	332 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	MFAP4	P55083	255 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TMEM258	P61165	79 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	PRCD	Q00LT1	54 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	THAP8	Q8NA92	274 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	BAALC	Q8WXS3	180 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	C18orf15	Q96N68	181 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	CNFN	Q9BYD5	112 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	ANK2	Q01484	3957 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	DNHD1	Q96M86	4753 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947		A0A096LNT2	108 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	PGP	A6NDG6	321 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TCRA	P04437	139 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	DEFA4	P12838	97 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF32	P17041	273 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	CA6	P23280	308 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	AAED1	Q7RTV5	226 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	AMN1	Q8IY45	258 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	LINC01560	Q8TB33	94 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	FXYD5	Q96DB9	178 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	TIMD4	Q96H15	378 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	OTOR	Q9NRC9	128 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		3.65	□□□□□ -1.82
CBFB-208	ENST00000567947	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	TMEM178B	H3BS89	294 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947		K7ERJ3	54 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	LGALS9	O00182	355 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	OVOL1	O14753	267 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	SLC25A20	O43772	301 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	COX7A2P2	O60397	106 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CBFB-208	ENST00000567947	NGF	P01138	241 aa		3.65	□□□□□ -1.83

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