RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561300.1

TMOD2-205, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD2, Length 542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-205ENST00000561300 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 FOXI2Q6ZQN5 318 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 TTC9CQ8N5M4 171 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 SPTSSBQ8NFR3 76 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 DYNLRB2Q8TF09 96 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 LINC00526Q96FQ7 95 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 NDUFA12Q9UI09 145 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 UNC13CQ8NB66 2214 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 LAMB1P07942 1786 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 CHD1O14646 1710 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 TET3O43151 1660 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 RBAKDNA6NC62 111 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 A6NIN4 97 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 F8W1H4 67 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 SLC25A6P12236 298 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 PIPP12273 146 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 Q1T7F1 81 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 C1orf137Q5JT78 98 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 FAM74A1Q5RGS3 127 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 C10orf55Q5SWW7 151 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 Q6AWC8 147 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 C9orf62Q8N4C0 152 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 Q8N8P6 123 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 VAMP8Q9BV40 100 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 SPANXDQ9BXN6 97 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 AP4S1Q9Y587 144 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 V9GYS6 101 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 KIF20BQ96Q89 1820 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 MAPKBP1O60336 1514 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 LOC285556D6RIA3 1793 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 ALPK2Q86TB3 2170 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD2-205ENST00000561300 LAMA4Q16363 1823 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PPLO60437 1756 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ARHGAP5Q13017 1502 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 A0A087WSZ3 146 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TMEM262E9PQX1 116 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 H3BRM9 83 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 GNGT2O14610 69 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 DNAL4O96015 105 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MT-ATP8P03928 68 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 GYPBP06028 91 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CNBPP62633 177 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PDE6HQ13956 83 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 RHOHQ15669 191 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SPANXN1Q5VSR9 72 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CSAG1Q6PB30 78 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 COA5Q86WW8 74 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TMEM141Q96I45 108 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 AQP10Q96PS8 301 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 REG4Q9BYZ8 158 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 DPY30Q9C005 99 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ATG5Q9H1Y0 275 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 DPH3P1Q9H4G8 78 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 FAIMQ9NVQ4 179 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 KLK9Q9UKQ9 250 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MON2Q7Z3U7 1717 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 NRXN2Q9P2S2 1712 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 DLEC1Q9Y238 1755 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CCL16O15467 120 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PPYP01298 95 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 LINC00032P0C843 101 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 COX7CP15954 63 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 CBLN1P23435 193 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 DCDP81605 110 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 C12orf73Q69YU5 71 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SLC48A1Q6P1K1 146 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 LYPD5Q6UWN5 251 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 SBSPONQ8IVN8 264 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 C15orf53Q8NAA6 179 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 C10orf82Q8WW14 230 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PPDPFLQ8WWR9 84 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 PATE1Q8WXA2 126 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 TSLPQ969D9 159 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD2-205ENST00000561300 LINC00052Q96N35 136 aa0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms