RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 LRP5O75197 1615 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PPP5D1E7EU14 171 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 GABARAPH6UMI1 98 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 IFNA1P01562 189 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 HBDP02042 147 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CSN2P05814 226 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM6P0DI80 62 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CRYGSP22914 178 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 AKR1D1P51857 326 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TCTAP57738 103 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TMED2Q15363 201 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 LTC4SQ16873 150 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 OR2T2Q6IF00 324 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFA11Q86Y39 141 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 C20orf197Q8N268 126 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 OTOSQ8NHW6 89 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CARD19Q96LW7 228 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PRAP1Q96NZ9 151 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SS18L2Q9UHA2 77 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ERG28Q9UKR5 140 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PLB1Q6P1J6 1458 aa-0.44□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PLXNB2O15031 1838 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TSC2P49815 1807 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PTPRGP23470 1445 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 BCL9LQ86UU0 1499 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 M0R2P5 195 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PFDN1O60925 122 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 NIPSNAP2O75323 286 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 S100A11P31949 105 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CRYBA4P53673 196 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 REEP5Q00765 189 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PLGLB1Q02325 96 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SLC25A26Q70HW3 274 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 STX19Q8N4C7 294 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 IFI27L1Q96BM0 104 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 GINS3Q9BRX5 216 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC32Q9BV29 185 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 UFC1Q9Y3C8 167 aa-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TECPR2O15040 1411 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 GOLGA3Q08378 1498 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1B0GW64 132 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 G3V318 75 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 M0QZK8 103 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 M0R2T5 61 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 UQCRQO14949 82 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SPINK4O60575 86 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SLC25A6P12236 298 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 GNG3P63215 75 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PSPHP78330 225 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SPCS2Q15005 226 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 DYNLRB2Q8TF09 96 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CBLN4Q9NTU7 201 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CASZ1Q86V15 1759 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 NBASA2RRP1 2371 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 FAM92AA1XBS5 289 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC179H3BU77 68 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 BCE1O60756 84 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 FAM107AO95990 144 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TNFP01375 233 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 RBP4P02753 201 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 CTXN2P0C2S0 81 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SPRR2AP35326 72 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 EDDM3BP56851 147 aa-0.47□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms