RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 ERVFC1-1P60608 527 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGGTA-208ENST00000558954 IFITM2Q01629 132 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGGTA-208ENST00000558954 ESRGQ1W209 222 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM241Q24JQ0 296 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGGTA-208ENST00000558954 AP1S3Q96PC3 154 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGGTA-208ENST00000558954 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.05□□□□□ -0.32
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RABGGTA-208ENST00000558954 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
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RABGGTA-208ENST00000558954 CT83Q5H943 113 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGGTA-208ENST00000558954 SOHLH1Q5JUK2 328 aa13.04□□□□□ -0.32
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RABGGTA-208ENST00000558954 UPK3BQ9BT76 320 aa13.04□□□□□ -0.32
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RABGGTA-208ENST00000558954 ADIRFQ15847 76 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF56Q15929 161 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGGTA-208ENST00000558954 Q6ZSN1 163 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGGTA-208ENST00000558954 C15orf54Q8N8G6 183 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGGTA-208ENST00000558954 OSTCQ9NRP0 149 aa13.02□□□□□ -0.33
RABGGTA-208ENST00000558954 RYR3Q15413 4870 aa13.02□□□□□ -0.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 TRGC1P0CF51 173 aa13□□□□□ -0.33
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB4BP61018 213 aa13□□□□□ -0.33
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR73Q6P4I2 378 aa13□□□□□ -0.33
RABGGTA-208ENST00000558954 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RABGGTA-208ENST00000558954 DNAH6Q9C0G6 4158 aa13□□□□□ -0.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 Q9H8V8 135 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGGTA-208ENST00000558954 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.98□□□□□ -0.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 TSKUQ8WUA8 353 aa12.98□□□□□ -0.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.98□□□□□ -0.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 TTC32Q5I0X7 151 aa12.96□□□□□ -0.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 V9GYV3 84 aa12.96□□□□□ -0.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGGTA-208ENST00000558954 PGLYRP4Q96LB8 373 aa12.95□□□□□ -0.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.95□□□□□ -0.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 WFDC10BQ8IUB3 73 aa12.92□□□□□ -0.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 LELP1Q5T871 98 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTA-208ENST00000558954 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A087WWC5 75 aa12.9□□□□□ -0.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 OR10J3Q5JRS4 329 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGGTA-208ENST00000558954 NAT8BQ9UHF3 227 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGGTA-208ENST00000558954 M0QY20 66 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf134Q5TEV5 83 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGGTA-208ENST00000558954 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGGTA-208ENST00000558954 COMMD7Q86VX2 200 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGGTA-208ENST00000558954 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
RABGGTA-208ENST00000558954 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGGTA-208ENST00000558954 K7EP13 123 aa12.88□□□□□ -0.35
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