RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555547.5

SRSF5-211, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 5, humanhuman

TSL 5

Gene SRSF5, Length 2,057 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5-211ENST00000555547 Q6ZVQ6 151 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 LCA10Q71F78 164 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 RITA1Q96K30 269 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 TMEM243Q9BU79 118 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 LINC01548A6NM66 108 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 C9JCJ5 164 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 H3BMM0 161 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 CACNG7P62955 275 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 UBE2WQ96B02 151 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.18□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 LST1O00453 97 aa7.17□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 HBDP02042 147 aa7.17□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.17□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 Q8N8P6 123 aa7.17□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.17□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 NXPH3O95157 252 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 CCKP06307 115 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 ZNF329Q86UD4 541 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 V9GYV3 84 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 Q8N3U1 123 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 TIMM17AQ99595 171 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 ZNF747Q9BV97 191 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 SEC16AO15027 2179 aa7.16□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 A0A1W2PQD3 144 aa7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 FREM3P0C091 2139 aa7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 TOMM6Q96B49 74 aa7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 OSTCQ9NRP0 149 aa7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 ARID1AO14497 2285 aa7.15□□□□□ -1.26
SRSF5-211ENST00000555547 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 LINC00473A8K010 186 aa7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 NPPCP23582 126 aa7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 FHL2Q14192 279 aa7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 GPHA2Q96T91 129 aa7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 Q9H3A6 140 aa7.15□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.14□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.14□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 H0Y9J4 135 aa7.14□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 M0R381 172 aa7.14□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 Q75L30 129 aa7.14□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.14□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 KLLNB2CW77 178 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 UBE2D1P51668 147 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 RIGQ13278 110 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 VPS13CQ709C8 3753 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 C11orf94C9JXX5 98 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 H3BVH4 76 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 IGKV3-11P04433 115 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 GNB1P62873 340 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 CUBNO60494 3623 aa7.13□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 PRR25Q96S07 402 aa7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 CCL13Q99616 98 aa7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 FSTL3O95633 263 aa7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 DYNLT3P51808 116 aa7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 KISS1Q15726 138 aa7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.12□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.11□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 H7BZZ5 65 aa7.11□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 BCE1O60756 84 aa7.11□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.11□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 NDUFC1O43677 76 aa7.1□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.1□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.1□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.1□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.1□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.1□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 C11orf52Q96A22 123 aa7.1□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 Q9HAA7 133 aa7.1□□□□□ -1.27
SRSF5-211ENST00000555547 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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