RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 A0A087WWL8 130 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 BCL2L11O43521 198 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 LTAP01374 205 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 DNLZQ5SXM8 178 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 Q8N1X5 172 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 RHODO00212 210 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 TMUB2Q71RG4 321 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 BAGE2Q86Y30 109 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 Q9UF83 564 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 A0A087WWC5 75 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 J3QL48 77 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 GCSHP23434 173 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 SSTP61278 116 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 PRR27Q6MZM9 219 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 ZFP82Q8N141 532 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 SFRP2Q96HF1 295 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 TM2D2Q9BX73 214 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 TEX46H3BTG2 121 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 GNG13Q9P2W3 67 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 F5H697 171 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 KRTAP10-1P60331 282 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 TOR2AQ5JU69 321 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 Q8N3U1 123 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 HERC1Q15751 4861 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 EPM2AB3EWF7 344 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 RAB5CP51148 216 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 RAB4BP61018 213 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 CCL20P78556 96 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 LAGE3Q14657 143 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 ZNF56Q15929 161 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 Q8N814 137 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 MLST8Q9BVC4 326 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 MANBALQ9NQG1 85 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 A0A087WX48 190 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 TMEM262E9PQX1 116 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 SMIM17P0DL12 118 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 LINC00694P0DN24 101 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 XGP55808 180 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 KLK12Q9UKR0 248 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 IFNA1P01562 189 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 ELOBQ15370 118 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 NIT1Q86X76 327 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 RMI2Q96E14 147 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 DERL1Q9BUN8 251 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 TPPP3Q9BW30 176 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 COX11Q9Y6N1 276 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 MYCBP2O75592 4640 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 RAB19A4D1S5 217 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 LECT2O14960 151 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 SNAI2O43623 268 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 CXCL1P09341 107 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 OR5AL1P0C617 328 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 GNG4P50150 75 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 SULT1A2P50226 295 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 UBE2D3P61077 147 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 UBE2D2P62837 147 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 CENPWQ5EE01 88 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 BAALCQ8WXS3 180 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 FRZBQ92765 325 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 UBE2WQ96B02 151 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 MED9Q9NWA0 146 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 PDE6DO43924 150 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 GZMBP10144 247 aa5.98□□□□□ -1.45
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