RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511598.5

RBM47-208, Transcript of RNA binding motif protein 47, human

TSL 2

Gene RBM47, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM47-208	ENST00000511598	SNAI2	O43623	268 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598	UQCC3	Q6UW78	93 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598	LINC00862	A6NCI5	91 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598	OR5AL1	P0C617	328 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598	SFRP2	Q96HF1	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598	OSTC	Q9NRP0	149 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM47-208	ENST00000511598		A8MWV9	139 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	PAX4	O43316	350 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	MUC4	Q99102	2169 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598		A0A087WWL8	130 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598		A8MWL6	223 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	C6orf223	Q8N319	242 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	PRO0255	Q9UI72	69 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	TMEM218	A2RU14	115 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598		F8W036	122 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	CRYBA4	P53673	196 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	GTSF1	Q8WW33	167 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598		F2Z2F3	143 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	SLA	Q13239	276 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598		V9GYV3	84 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	PKD1	P98161	4303 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	NXPH4	O95158	308 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	CACNG7	P62955	275 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	TNP2	Q05952	138 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	CT83	Q5H943	113 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598		Q9H8V8	135 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598		H3BNG1	76 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	CTRL	P40313	264 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	TSKU	Q8WUA8	353 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	CIDEA	O60543	219 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	CRYGD	P07320	174 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	GYPE	P15421	78 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	ADCYAP1	P18509	176 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	NTF3	P20783	257 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	TWIST1	Q15672	202 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	ESRG	Q1W209	222 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	TTC32	Q5I0X7	151 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598		Q6ZSN1	163 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM47-208	ENST00000511598		A0A096LPF7	62 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	RHOD	O00212	210 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	SMIM17	P0DL12	118 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	AP1S3	Q96PC3	154 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	MGP	P08493	103 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	ZNF56	Q15929	161 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	SEC11C	Q9BY50	192 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598		F5H697	171 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	TRGC1	P0CF51	173 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	RHOH	Q15669	191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	UPK3B	Q9BT76	320 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	C16orf90	A8MZG2	172 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598		K7EQD1	137 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	EVI2A	P22794	236 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	FAM231B	A6NCW3	169 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	PPP1R2P9	O14990	202 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	MT-ND4L	P03901	98 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM47-208	ENST00000511598		A0A1B0GUT8	65 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM47-208	ENST00000511598	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM47-208	ENST00000511598	SRI	P30626	198 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM47-208	ENST00000511598		Q9UF83	564 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM47-208	ENST00000511598	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM47-208	ENST00000511598	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM47-208	ENST00000511598	RAB4B	P61018	213 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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