RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510324.1

CASP6-208, Transcript of caspase 6, human

TSL 2

Gene CASP6, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP6-208	ENST00000510324	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324		Q9UF83	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	PHOX2A	O14813	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	GCG	P01275	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	TMBIM6	P55061	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	NHLH2	Q02577	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP6-208	ENST00000510324	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324		A0A087WYN8	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324		K7EQM0	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	GNG5	P63218	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	RAB32	Q13637	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	JPT2	Q9H910	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324		V9GYH0	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324		A0A087WWL8	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324		A0A0J9YXV3	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324		A0A1W2PPV4	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324		H3BMQ9	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	RHOD	O00212	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	MIA	Q16674	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	PKIA	P61925	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324		A0A0U1RQV1	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324		H3BVH4	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	UBE2D3	P61077	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	UBE2D2	P62837	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324		B4DEV8	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	PTTG1	O95997	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	TCRB	P04435	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	TCRA	P04437	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	BTC	P35070	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	RAB5C	P51148	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	FOXI1	Q12951	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	GAGE6	Q13070	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP6-208	ENST00000510324	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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