RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 C1orf134Q5TEV5 83 aa12.24□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.24□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 LINC00336Q6ZUF6 198 aa12.24□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 TTC32Q5I0X7 151 aa12.23□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPANXN1Q5VSR9 72 aa12.23□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUDT10Q8NFP7 164 aa12.23□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUDT11Q96G61 164 aa12.23□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa12.23□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAT2Q9NYQ8 4349 aa12.23□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 SIVA1O15304 175 aa12.22□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 SRP19P09132 144 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGLC6P0CF74 106 aa12.22□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa12.22□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A1W2PPQ1 181 aa12.21□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 XKRY2A2RUG3 117 aa12.21□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 TIRAPP58753 221 aa12.21□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 SSTP61278 116 aa12.21□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 SOHLH1Q5JUK2 328 aa12.21□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 C6orf223Q8N319 242 aa12.21□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 TPPP3Q9BW30 176 aa12.21□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 GAGE12JA6NER3 117 aa12.2□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 LINC00694P0DN24 101 aa12.2□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 GAGE1Q13065 139 aa12.2□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 GAGE4Q13068 117 aa12.2□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 GAGE5Q13069 117 aa12.2□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 GAGE13Q4V321 117 aa12.2□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 WFDC10BQ8IUB3 73 aa12.2□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 Q9UF83 564 aa12.2□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRSS29PA6NIE9 313 aa12.19□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa12.19□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMIM7Q9BQ49 75 aa12.19□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 LY96Q9Y6Y9 160 aa12.19□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa12.19□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAB4BP61018 213 aa12.17□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 CACNG7P62955 275 aa12.17□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF56Q15929 161 aa12.17□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.17□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 GTSF1LQ9H1H1 148 aa12.17□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.17□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF727A8MUV8 499 aa12.16□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 F2Z2F3 143 aa12.16□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM231DQ6ZW35 169 aa12.16□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 AP1S3Q96PC3 154 aa12.16□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.16□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.15□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 C9JQL5 133 aa12.15□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 GATCO43716 136 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMIM17P0DL12 118 aa12.15□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 LELP1Q5T871 98 aa12.15□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 LINC01551Q86U37 167 aa12.15□□□□□ -0.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A1B0GVY2 172 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNAH10OSP0CZ25 163 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTRLP40313 264 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 LINC00315P59091 139 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 PEA15Q15121 130 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR10J3Q5JRS4 329 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 F5H697 171 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 BTF3P20290 206 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERVFC1-1P60608 527 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM74A3Q4VXF1 159 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 WDR73Q6P4I2 378 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 NTF3P20783 257 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 EVI2AP22794 236 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR10G8Q8NGN5 311 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 GTSF1Q8WW33 167 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMDT1Q9H4I9 107 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 MGPP08493 103 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRGC1P0CF51 173 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 TNP2Q05952 138 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM241Q24JQ0 296 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 CT83Q5H943 113 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 CNFNQ9BYD5 112 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 A8MWL6 223 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 K7EP13 123 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 UBE2D3P61077 147 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 UBE2D2P62837 147 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 LINC01556Q5JQF7 62 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A087WWC5 75 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPL23P62829 140 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 TWIST1Q15672 202 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 OSTCQ9NRP0 149 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAB14P61106 215 aa12.08□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 C10orf126Q8N4M7 172 aa12.08□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 ISOC2Q96AB3 205 aa12.08□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 PGLYRP4Q96LB8 373 aa12.08□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.08□□□□□ -0.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAT8Q9UHE5 227 aa12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms