RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A0J9YXV3	536 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R17	O96001	155 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHG4	P01861	327 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	IFITM1	P13164	125 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CDIP1	Q9H305	208 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	ATXN8	Q156A1	80 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292		F8W735	103 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	OVOL3	O00110	214 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CARD19	Q96LW7	228 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A0J9YY99	117 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	TRBV12-3	P01733	135 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	DAND5	Q8N907	189 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	DUX3	Q96PT4	197 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	RS1	O15537	224 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BMM0	161 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292		M0R2P5	195 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292		Q8N9W7	124 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	NPB	Q8NG41	125 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2W	Q96B02	151 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	PRO0461	Q9UI25	63 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	OVOL1	O14753	267 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	C20orf173	Q96LM9	149 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	DUX5	Q96PT3	197 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	ID1	P41134	155 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	KLRB1	Q12918	225 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	HERV-K104	P63124	156 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC140	Q96MF4	163 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292		Q8N1Y9	231 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	PIFO	Q8TCI5	191 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CLEC2B	Q92478	149 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	LY6L	H3BQJ8	138 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01620	Q4KN68	170 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292		M0R1W7	72 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	FHL3	Q13643	280 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	CNFN	Q9BYD5	112 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	LRBA	P50851	2863 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	CRLF1	O75462	422 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292		A8MZ25	164 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF580	Q9UK33	172 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292		Q6ZSV7	163 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3-30	P01768	117 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2D1	P51668	147 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	ZZEF1	O43149	2961 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM141	Q96I45	108 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	AJUBA	Q96IF1	538 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	NPFF	O15130	113 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		7.42	□□□□□ -1.22

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