RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 CSN3P07498 182 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 LINC00614P0C842 121 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 HLA-DRB4P13762 266 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 NTF3P20783 257 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 ASIPP42127 132 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 CAMPP49913 170 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 ATRQ13535 2644 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 TMEM95Q3KNT9 176 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 FAM104BQ5XKR9 115 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 LYZL1Q6UWQ5 148 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 FAM159AQ6UWV7 190 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 RNF182Q8N6D2 247 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SGK494Q96LW2 274 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 GPR61Q9BZJ8 451 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SCRT2Q9NQ03 307 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 ESM1Q9NQ30 184 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 NAGKQ9UJ70 344 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 ZFHX3Q15911 3703 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 TACC2O95359 2948 aa2.89□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 C20orf202A1L168 122 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 LINC01546A6NGU7 62 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 HSBP1O75506 76 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 NXPH4O95158 308 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 CA1P00915 261 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SRIP30626 198 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 TCL1AP56279 114 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 ERCC8Q13216 396 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SLAQ13239 276 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 PMCHL1Q16048 86 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 NFE4Q86UQ8 179 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 POM121L12Q8N7R1 296 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 C18orf32Q8TCD1 76 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 C12orf57Q99622 126 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 C20orf78Q9BR46 151 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SPXQ9BT56 116 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SAMD10Q9BYL1 202 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 EDA2RQ9HAV5 297 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.88□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 OR11H12B2RN74 326 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 H3BMM0 161 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 H7C1H1 209 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 VCYO14598 125 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SERF1AO75920 110 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 IGLV1-51P01701 117 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 ZNF688P0C7X2 276 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SMIM17P0DL12 118 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 FABP4P15090 132 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 HLA-DMBP28068 263 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 CKS2P33552 79 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 C10orf99Q6UWK7 81 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 NIT1Q86X76 327 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 AMN1Q8IY45 258 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 TMEM61Q8N0U2 210 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 OR10D4PQ8NGN7 298 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 Q8TAT8 98 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 AP1S3Q96PC3 154 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 FN1P02751 2386 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SMIM9A6NGZ8 99 aa2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 A8MWV9 139 aa2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 USP17L23D6RBM5 183 aa2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 TSTD3H0UI37 97 aa2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 SPINK4O60575 86 aa2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 INSP01308 110 aa2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 GZMBP10144 247 aa2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 CD28P10747 220 aa2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RARB-208ENST00000489694 GAGE5Q13069 117 aa2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms