RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481114.1

SDCCAG3-210, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-210ENST00000481114 B4DEV8 164 aa8.6□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 PANO1I0J062 215 aa8.6□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 STAG3L2P0CL84 134 aa8.6□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 STAG3L3P0CL85 134 aa8.6□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 PET100P0DJ07 73 aa8.6□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 GCHFRP30047 84 aa8.6□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 CCDC32Q9BV29 185 aa8.6□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.6□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 MPC2O95563 127 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 UBE2D3P61077 147 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 UBE2D2P62837 147 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 MPV17L2Q567V2 206 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 SFRP2Q96HF1 295 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-210ENST00000481114 RNF213Q63HN8 5207 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 LRP2P98164 4655 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 H2BFSP57053 126 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 MIAQ16674 131 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 ENKURQ8TC29 256 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 SUN5Q8TC36 379 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 RAB24Q969Q5 203 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 DPH3Q96FX2 82 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.57□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 M0R036 132 aa8.57□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 M0R381 172 aa8.57□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 DNLZQ5SXM8 178 aa8.57□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.57□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.56□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 PKIAP61925 76 aa8.56□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.56□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 PTTG1O95997 202 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 CXorf1O96002 111 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 IFNA7P01567 189 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q86TA4 180 aa8.54□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZFP82Q8N141 532 aa8.54□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A1W2PRE2 83 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 SSNA1O43805 119 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 SH2D1AO60880 128 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 MBP02144 154 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 CRIP1P50238 77 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A087WYN8 130 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 hDV102S1A0JD36 115 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 PEX7O00628 323 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 RAB4BP61018 213 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF56Q15929 161 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 RNF185Q96GF1 192 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRR34Q9NV39 138 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 TNXBP22105 4242 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 CHTF8P0CG12 524 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 ATP6V0CP27449 155 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 UBE2G2P60604 165 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 RBX1P62877 108 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 GAGE6Q13070 117 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 C7orf33Q8WU49 177 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC01600Q96MT4 127 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 PHOX2AO14813 284 aa8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 SERF2P84101 59 aa8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 ODF1Q14990 250 aa8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC01559Q495D7 138 aa8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRR27Q6MZM9 219 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.48□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 F5H697 171 aa8.48□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 UBE2G1P62253 170 aa8.48□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 REG3AQ06141 175 aa8.48□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.48□□□□□ -1.05
SDCCAG3-210ENST00000481114 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 180.2 ms