RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1W2PPQ1	181 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959		K7EN84	100 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAGE1	Q13065	139 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAGE4	Q13068	117 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAGE5	Q13069	117 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TOR2A	Q5JU69	321 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q8N3U1	123 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYT8	Q8NBV8	401 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		7.55	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	CIDEA	O60543	219 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGLC6	P0CF74	106 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	BLOC1S1	P78537	153 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	RHOD	O00212	210 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR5AL1	P0C617	328 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	TIRAP	P58753	221 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SST	P61278	116 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM12	Q96EX1	92 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	HERC2	O95714	4834 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959		P01737	135 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEBPG	P53567	150 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF56	Q15929	161 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	LELP1	Q5T871	98 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	OCC1	Q8TAD7	63 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUDT11	Q96G61	164 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	TPPP3	Q9BW30	176 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM250	H0YL14	139 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHV3-30	P01768	117 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHV3-33	P01772	117 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM210A	Q96ND0	272 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	7.49	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP10-2	P60368	255 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	AP1S3	Q96PC3	154 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959		C9JQL5	133 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	EVI2A	P22794	236 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTRL	P40313	264 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE2D3	P61077	147 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE2D2	P62837	147 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	TEX261	Q6UWH6	196 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	MGP	P08493	103 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB4B	P61018	213 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTSF1	Q8WW33	167 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	RYR1	P21817	5038 aa		7.46	□□□□□ -1.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		7.46	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC01551	Q86U37	167 aa		7.46	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		7.46	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q9HAA7	133 aa		7.46	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	BIN3	Q9NQY0	253 aa		7.46	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959		F5H697	171 aa		7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	NTF3	P20783	257 aa		7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	CACNG7	P62955	275 aa		7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNFN	Q9BYD5	112 aa		7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		7.45	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		7.44	□□□□□ -1.22

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