RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466638.5

PNCK-222, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 2

Gene PNCK, Length 1,204 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-222	ENST00000466638	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	XKRY2	A2RUG3	117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638		K7EN84	100 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	CRYGD	P07320	174 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	TPPP3	Q9BW30	176 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	GAGE12J	A6NER3	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	IGLC6	P0CF74	106 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	GAGE1	Q13065	139 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	GAGE4	Q13068	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	GAGE5	Q13069	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	NUDT11	Q96G61	164 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	TIRAP	P58753	221 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638		Q9UF83	564 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF727	A8MUV8	499 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	LINC00694	P0DN24	101 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF56	Q15929	161 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	AP1S3	Q96PC3	154 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638		F2Z2F3	143 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	SMIM17	P0DL12	118 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	RAB4B	P61018	213 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	CACNG7	P62955	275 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638		F5H697	171 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	CTRL	P40313	264 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	PEA15	Q15121	130 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	LELP1	Q5T871	98 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638		C9JQL5	133 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	EVI2A	P22794	236 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	LINC00315	P59091	139 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638		A0A1B0GVY2	172 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MGP	P08493	103 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	NTF3	P20783	257 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638		K7EP13	123 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	TRGC1	P0CF51	173 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	TNP2	Q05952	138 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNCK-222	ENST00000466638		A8MWL6	223 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	UBE2D3	P61077	147 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	UBE2D2	P62837	147 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	TWIST1	Q15672	202 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	WDR73	Q6P4I2	378 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	CNFN	Q9BYD5	112 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638		A0A087WWC5	75 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	RAB14	P61106	215 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	CT83	Q5H943	113 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	IGHV3-33	P01772	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNCK-222	ENST00000466638	NAT8	Q9UHE5	227 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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