RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE12IP0CL82 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 HTN3P15516 51 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 NTF3P20783 257 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 ELOBQ15370 118 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 RASL11AQ6T310 242 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZTC4 211 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 BTF3L4Q96K17 158 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 AP1S3Q96PC3 154 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TPPP3Q9BW30 176 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 CIDEAO60543 219 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP5G1P05496 136 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 HBBP68871 147 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 RIGQ13278 110 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 JPT2Q9H910 190 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 F5H768 121 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 RHODO00212 210 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TRGC1P0CF51 173 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 HOXA5P20719 270 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 EVI2AP22794 236 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 S100PP25815 95 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 FHL2Q14192 279 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 CASC10Q5T4H9 136 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF479Q96JC4 524 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 S100A8P05109 93 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TCTAP57738 103 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TWIST1Q15672 202 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 BORCS7Q96B45 105 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF185Q96GF1 192 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM210BQ96KR6 192 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A087WWL8 130 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 COLCA2A8K830 154 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLL5B9A064 214 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 SCO1O75880 301 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV3-53P01767 116 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00694P0DN24 101 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZSN1 163 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 FRZBQ92765 325 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB4BP61018 213 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 SLAQ13239 276 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 COX19Q49B96 90 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 H3BNG1 76 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 M0QY20 66 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 PHOX2AO14813 284 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 HLA-DQA1P01909 254 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 MT-ND6P03923 174 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB4AP20338 218 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 CAMPP49913 170 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 CRYBA4P53673 196 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 AMN1Q8IY45 258 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 SMIM17P0DL12 118 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 SSTP61278 116 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 MRAP2Q96G30 205 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 PRO0255Q9UI72 69 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 K7EQD1 137 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 GAS8-AS1O95177 125 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 NUDT3O95989 172 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 RHOHQ15669 191 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 NRACQ8N912 160 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 Q9UF83 564 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 PAX4O43316 350 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 PPBPP02775 128 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms