RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504		M0R2P5	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	GNRH2	O43555	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF253	O75346	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	PPBP	P02775	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	GAGE4	Q13068	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	GAGE5	Q13069	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB31	Q13636	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504		Q8TAT8	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A087WWC5	75 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A087WYN8	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	TAAR5	O14804	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	PRSS1	P07477	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF138	P52744	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	CEBPG	P53567	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	SRPX	P78539	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	NIT1	Q86X76	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	NDUFB4	O95168	129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	MUC2	Q02817	5179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A087WX48	190 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504		K7EPK0	472 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	RBX1	P62877	108 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF266	Q14584	549 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	ELOB	Q15370	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504		Q6ZRG5	221 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	PRRT1	Q99946	306 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	PGP	A6NDG6	321 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504		B4DEV8	164 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	SSSCA1	O60232	199 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	PYY	P10082	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC25A6	P12236	298 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	G0S2	P27469	103 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	FHIT	P49789	147 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	H2BFS	P57053	126 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HDLBP-222	ENST00000449504	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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