RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPANXN1Q5VSR9 72 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BIRC6Q9NR09 4857 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 XKRY2A2RUG3 117 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SH2D6Q7Z4S9 175 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMIM7Q9BQ49 75 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TPPP3Q9BW30 176 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SSTP61278 116 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LY96Q9Y6Y9 160 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FRAS1Q86XX4 4008 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF727A8MUV8 499 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SIVA1O15304 175 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RTL8CO15255 209 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 Q9UF83 564 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GAGE12JA6NER3 117 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C9JQL5 133 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LINC00694P0DN24 101 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TIRAPP58753 221 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GAGE1Q13065 139 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GAGE4Q13068 117 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GAGE5Q13069 117 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PEA15Q15121 130 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GAGE13Q4V321 117 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TTC32Q5I0X7 151 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM231DQ6ZW35 169 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LINC01551Q86U37 167 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A1W2PPQ1 181 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 F2Z2F3 143 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CACNG7P62955 275 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C1orf134Q5TEV5 83 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LYZL1Q6UWQ5 148 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GATCO43716 136 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AP1S3Q96PC3 154 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ERVFC1-1P60608 527 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF56Q15929 161 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LINC00336Q6ZUF6 198 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WFDC10BQ8IUB3 73 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMDT1Q9H4I9 107 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MSRB1Q9NZV6 116 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CTRLP40313 264 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RAB4BP61018 213 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM74A3Q4VXF1 159 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SOHLH1Q5JUK2 328 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DNAH17Q9UFH2 4485 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C6orf223Q8N319 242 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GTSF1LQ9H1H1 148 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMIM17P0DL12 118 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RAB14P61106 215 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM241Q24JQ0 296 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GTSF1Q8WW33 167 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAT2Q9NYQ8 4349 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRSS29PA6NIE9 313 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 F5H697 171 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NTF3P20783 257 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LINC00315P59091 139 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CT83Q5H943 113 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WDR73Q6P4I2 378 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CNFNQ9BYD5 112 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A8MWL6 223 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LELP1Q5T871 98 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OSTCQ9NRP0 149 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DNAH10OSP0CZ25 163 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPL23P62829 140 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR10J3Q5JRS4 329 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NAT8Q9UHE5 227 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRGC1P0CF51 173 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EVI2AP22794 236 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR10G8Q8NGN5 311 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ISOC2Q96AB3 205 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MGPP08493 103 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UBE2D3P61077 147 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UBE2D2P62837 147 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IFITM2Q01629 132 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TWIST1Q15672 202 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADIRFQ15847 76 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLLU1Q5K131 121 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BTF3P20290 206 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C15orf54Q8N8G6 183 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DPH3P1Q9H4G8 78 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TSKUQ8WUA8 353 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PGLYRP4Q96LB8 373 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 K7EP13 123 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 V9GYV3 84 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A087WWC5 75 aa18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms