RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 HIVEP1P15822 2718 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 TMEM89A2RUT3 159 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 TM4SF20Q53R12 229 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 HERVK_113P61574 105 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 WFDC11Q8NEX6 87 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 TIMM17AQ99595 171 aa10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 ACANP16112 2415 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 VCYO14598 125 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 RIPPLY3P57055 190 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 LINC00315P59091 139 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 TMEM219Q86XT9 240 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 ZANQ9Y493 2812 aa10.72□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 LYRM7Q5U5X0 104 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa10.71□□□□□ -0.69
TTLL1-203ENST00000439248 K7ERJ3 54 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 CFHR3Q02985 330 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 Q6ZQT7 251 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 RNF152Q8N8N0 203 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.7□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 IGIPA6NJ69 53 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 LGALS9O00182 355 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 MGPP08493 103 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 PMVKQ15126 192 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 F8P00451 2351 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 TRBV12-3P01733 135 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 MSMBP08118 114 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 UBE2D1P51668 147 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 KIR2DL4Q99706 377 aa10.69□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 C11orf86A6NJI1 115 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 B4DSR2 109 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 RPL24P83731 157 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 RHOHQ15669 191 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 GAGE13Q4V321 117 aa10.68□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 MTORP42345 2549 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 GNRH2O43555 120 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 PF4V1P10720 104 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 GATA3P23771 443 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 SCGB2A2Q13296 93 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 SYT8Q8NBV8 401 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 C9orf85Q96MD7 179 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 PRO0461Q9UI25 63 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 TLN2Q9Y4G6 2542 aa10.67□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF815PA8K554 130 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 CRYGDP07320 174 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 LINC01356Q8N9X3 169 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 CSPG4Q6UVK1 2322 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 IGHV4-31P0DP07 118 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 DCANP1Q8TF63 244 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 SVEP1Q4LDE5 3571 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 TMEM238C9JI98 176 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 H3BUX3 64 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 TGFAP01135 160 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 NFE4Q86UQ8 179 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 SPATA25Q9BR10 227 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 KLK15Q9H2R5 256 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL1-203ENST00000439248 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF876PQ49A33 203 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 SIGMAR1Q99720 223 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 VCX2Q9H322 139 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 AGRNO00468 2067 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 TSHBP01222 138 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 WFDC2Q14508 124 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL1-203ENST00000439248 A0A0J9YY99 117 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms