RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 CTRLP40313 264 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 UQCC3Q6UW78 93 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 ISOC2Q96AB3 205 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 TPPP3Q9BW30 176 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 CNFNQ9BYD5 112 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 JPT2Q9H910 190 aa8.98□□□□□ -0.97
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HDLBP-210ENST00000423693 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.97□□□□□ -0.97
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HDLBP-210ENST00000423693 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 TSKUQ8WUA8 353 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 AP1S3Q96PC3 154 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-210ENST00000423693 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 A0A087WWL8 130 aa8.96□□□□□ -0.98
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HDLBP-210ENST00000423693 RAB4BP61018 213 aa8.96□□□□□ -0.98
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HDLBP-210ENST00000423693 GTSF1Q8WW33 167 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 UPK3BQ9BT76 320 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.96□□□□□ -0.98
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HDLBP-210ENST00000423693 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 TRGC1P0CF51 173 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 NTF3P20783 257 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 TIRAPP58753 221 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 Q6ZSN1 163 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 V9GYV3 84 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 BORCS7Q96B45 105 aa8.94□□□□□ -0.98
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HDLBP-210ENST00000423693 TWIST1Q15672 202 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.92□□□□□ -0.98
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HDLBP-210ENST00000423693 HIGD1CA8MV81 97 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 F5H697 171 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 PPP1R2P9O14990 202 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00315P59091 139 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF56Q15929 161 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 Q9H8V8 135 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.92□□□□□ -0.98
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HDLBP-210ENST00000423693 H7C1H1 209 aa8.91□□□□□ -0.98
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HDLBP-210ENST00000423693 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.9□□□□□ -0.98
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HDLBP-210ENST00000423693 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-210ENST00000423693 A0A087WWC5 75 aa8.89□□□□□ -0.99
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HDLBP-210ENST00000423693 K7EP13 123 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-210ENST00000423693 SIVA1O15304 175 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-210ENST00000423693 MT-ND4LP03901 98 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-210ENST00000423693 GAGE1Q13065 139 aa8.89□□□□□ -0.99
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HDLBP-210ENST00000423693 GAGE5Q13069 117 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-210ENST00000423693 GAGE13Q4V321 117 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-210ENST00000423693 Q6ZR54 194 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-210ENST00000423693 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-210ENST00000423693 NUP35Q8NFH5 326 aa8.89□□□□□ -0.99
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HDLBP-210ENST00000423693 M0QY20 66 aa8.88□□□□□ -0.99
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HDLBP-210ENST00000423693 TTC32Q5I0X7 151 aa8.88□□□□□ -0.99
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HDLBP-210ENST00000423693 Q9UF83 564 aa8.88□□□□□ -0.99
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