RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390394.3

TRBV20-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 20-1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV20-1, Length 413 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF575Q86XF7 245 aa6.86□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.86□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.86□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 BTF3L4Q96K17 158 aa6.86□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 H3BNG1 76 aa6.85□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 NTF3P20783 257 aa6.85□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.85□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.85□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.85□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 GTSF1Q8WW33 167 aa6.85□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.85□□□□□ -1.31
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TRBV20-1-201ENST00000390394 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.85□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.84□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.84□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 NUP35Q8NFH5 326 aa6.84□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 FRZBQ92765 325 aa6.84□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.84□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.84□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.84□□□□□ -1.31
TRBV20-1-201ENST00000390394 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.84□□□□□ -1.32
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TRBV20-1-201ENST00000390394 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.83□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 H7C1H1 209 aa6.83□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGHV3-53P01767 116 aa6.83□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 RAB4BP61018 213 aa6.83□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 SSTP61278 116 aa6.83□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 RHOHQ15669 191 aa6.83□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.83□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.83□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.83□□□□□ -1.32
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TRBV20-1-201ENST00000390394 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.82□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.82□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGLL5B9A064 214 aa6.82□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 F5H697 171 aa6.82□□□□□ -1.32
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TRBV20-1-201ENST00000390394 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 HBBP68871 147 aa6.82□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 FHL2Q14192 279 aa6.82□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 ZNF56Q15929 161 aa6.82□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 RASL11AQ6T310 242 aa6.82□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.82□□□□□ -1.32
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TRBV20-1-201ENST00000390394 EVI2AP22794 236 aa6.8□□□□□ -1.32
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TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.8□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 JPT2Q9H910 190 aa6.8□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.8□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.79□□□□□ -1.32
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TRBV20-1-201ENST00000390394 SRIP30626 198 aa6.79□□□□□ -1.32
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TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A0J9YY99 117 aa6.78□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 NUDT3O95989 172 aa6.78□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 GYPEP15421 78 aa6.78□□□□□ -1.32
TRBV20-1-201ENST00000390394 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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TRBV20-1-201ENST00000390394 PPBPP02775 128 aa6.77□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 MT-ND6P03923 174 aa6.77□□□□□ -1.33
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TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM231AP0DMU4 169 aa6.77□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM231CP0DMU5 169 aa6.77□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 CCL18P55774 89 aa6.77□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.77□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.77□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 GATD1Q8NB37 220 aa6.77□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.77□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.77□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.77□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.76□□□□□ -1.33
TRBV20-1-201ENST00000390394 HLA-DQA1P01909 254 aa6.76□□□□□ -1.33
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