RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB4BP61018 213 aa5.79□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 CENPWQ5EE01 88 aa5.79□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.79□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.79□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 PRR27Q6MZM9 219 aa5.79□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.79□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 F2Z2F3 143 aa5.78□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM250H0YL14 139 aa5.78□□□□□ -1.48
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MT-TS1-201ENST00000387416 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.78□□□□□ -1.48
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MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZSN1 163 aa5.78□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.78□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.78□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
MT-TS1-201ENST00000387416 DERL1Q9BUN8 251 aa5.78□□□□□ -1.48
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MT-TS1-201ENST00000387416 RAB19A4D1S5 217 aa5.77□□□□□ -1.49
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MT-TS1-201ENST00000387416 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV2-8P01709 118 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 SMIM17P0DL12 118 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00694P0DN24 101 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 ERVFC1-1P60608 527 aa5.77□□□□□ -1.49
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MT-TS1-201ENST00000387416 GAGE1Q13065 139 aa5.77□□□□□ -1.49
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MT-TS1-201ENST00000387416 GAGE5Q13069 117 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 GAGE13Q4V321 117 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 TOR2AQ5JU69 321 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 WDR73Q6P4I2 378 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 PKD1P98161 4303 aa5.77□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.76□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.76□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.76□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 LAGE3Q14657 143 aa5.76□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.76□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.76□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.76□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 AP1S3Q96PC3 154 aa5.76□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.76□□□□□ -1.49
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MT-TS1-201ENST00000387416 C16orf90A8MZG2 172 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 F5H697 171 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 H7C1H1 209 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLC6P0CF74 106 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 PKIAP61925 76 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 ELOBQ15370 118 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF56Q15929 161 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 COX11Q9Y6N1 276 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.75□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 PSCAO43653 123 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 TRGC1P0CF51 173 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2D3P61077 147 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2D2P62837 147 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 OCC1Q8TAD7 63 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 RMI2Q96E14 147 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 NUDT11Q96G61 164 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 CDK2AP2O75956 126 aa5.73□□□□□ -1.49
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MT-TS1-201ENST00000387416 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM210AQ96ND0 272 aa5.73□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 TPPP3Q9BW30 176 aa5.73□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 CNFNQ9BYD5 112 aa5.73□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.73□□□□□ -1.49
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MT-TS1-201ENST00000387416 A0A087WX48 190 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1B0GVG6 124 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 A8MWL6 223 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3-30P01768 117 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3-33P01772 117 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.72□□□□□ -1.49
MT-TS1-201ENST00000387416 GZMBP10144 247 aa5.72□□□□□ -1.49
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