RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 ADAMTS20P59510 1910 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 ARTNQ5T4W7 220 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 RNF152Q8N8N0 203 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 PTPRSQ13332 1948 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 ODF1Q14990 250 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 CTRLP40313 264 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 LRP4O75096 1905 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 SPATA25Q9BR10 227 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 BRK1Q8WUW1 75 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 APOC4P55056 127 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 LY6DQ14210 128 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 C11orf86A6NJI1 115 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 COX7B2Q8TF08 81 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 RMI2Q96E14 147 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 TIMM17AQ99595 171 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 RNF183Q96D59 192 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 CLEC2BQ92478 149 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 PIFOQ8TCI5 191 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 TCL1BO95988 128 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 DAND5Q8N907 189 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 K7EIM0 57 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 C3orf56Q8N813 242 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 U3KQE9 123 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 NREPQ16612 68 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 K7EQD1 137 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 I3L2K1 104 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 LHBP01229 141 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00643Q86TS7 51 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 C2orf70A6NJV1 201 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0J9YXV3 536 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 NPBQ8NG41 125 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 SVIPQ8NHG7 77 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1-17P01599 117 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 UQCRQO14949 82 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 PTH2Q96A98 100 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 A0A096LPF7 62 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 LECT2O14960 151 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 MT-ATP8P03928 68 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 PATE2Q6UY27 113 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 BUB3O43684 328 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 UBE2BP63146 152 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 C5orf38Q86SI9 138 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1B0GXF2 115 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 ELANEP08246 267 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 C16orf74Q96GX8 76 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 PDE6GP18545 87 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 C22orf46C9J442 243 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 GNLYP22749 145 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 LYPD6Q86Y78 171 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 UPK3BQ9BT76 320 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 COX7A2LO14548 114 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 LRRK2Q5S007 2527 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 MIAQ16674 131 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 MED14OSP0DP75 135 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV2-14P01704 120 aa6.81□□□□□ -1.32
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