RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 TRAV41A0A0B4J266 112 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 H3BUX3 64 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 SLC25A16P16260 332 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF688P0C7X2 276 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 TEX29Q8N6K0 151 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 IGF1P05019 195 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 EDN2P20800 178 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 A8MWV9 139 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 M0R381 172 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 CD7P09564 240 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 SORL1Q92673 2214 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 RBAKDNA6NC62 111 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 SMIM2Q9BVW6 85 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF554-201ENST00000317243 PRR9Q5T870 116 aa14.65□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.65□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 RASL10AQ92737 203 aa14.65□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 NF1P21359 2839 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 C16orf92Q96LL3 132 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 C20orf173Q96LM9 149 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 C10orf99Q6UWK7 81 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 BAALCQ8WXS3 180 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 METTL26Q96S19 204 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 CREBBPQ92793 2442 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 EMP1P54849 157 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 COX6B1P14854 86 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 TOMM6Q96B49 74 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 SRD5A1P18405 259 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 ARL3P36405 182 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 CITED1Q99966 193 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 VCX2Q9H322 139 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 S100A4P26447 101 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 MGPP08493 103 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 CFC1BP0CG36 223 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 CFC1P0CG37 223 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 PF4V1P10720 104 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 F6UB75 175 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 GPHB5Q86YW7 130 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 MSMBP08118 114 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 APCP25054 2843 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM262E9PQX1 116 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 A0A0J9YY99 117 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 CRLF1O75462 422 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC179H3BU77 68 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 CFAP161Q6P656 301 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 GAGE2BQ13066 116 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 KLK9Q2XQG4 91 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 GAGE2EQ4V326 116 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 RAX2Q96IS3 184 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 C9JAW5 83 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 RHODO00212 210 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 SLC25A20O43772 301 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 U3KQE9 123 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 A6NDX4 124 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 C11orf86A6NJI1 115 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 AKAP9Q99996 3911 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF554-201ENST00000317243 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms