RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 CRYGDP07320 174 aa17.1■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 RPS20P60866 119 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 C6orf223Q8N319 242 aa17.1■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 FAM210AQ96ND0 272 aa17.1■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 BIRC6Q9NR09 4857 aa17.1■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1W2PPQ1 181 aa17.09■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 GZMBP10144 247 aa17.09■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 CEBPGP53567 150 aa17.09■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 SPANXN1Q5VSR9 72 aa17.09■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 OCC1Q8TAD7 63 aa17.09■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 FAT2Q9NYQ8 4349 aa17.09■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 TIRAPP58753 221 aa17.08■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 SSTP61278 116 aa17.08■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 XKRY2A2RUG3 117 aa17.07■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 NUDT10Q8NFP7 164 aa17.07■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 NUDT11Q96G61 164 aa17.07■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 TPPP3Q9BW30 176 aa17.07■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa17.07■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 GAGE12JA6NER3 117 aa17.06■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 K7EN84 100 aa17.06■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 IGLC6P0CF74 106 aa17.06■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 GAGE1Q13065 139 aa17.06■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 GAGE4Q13068 117 aa17.06■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 GAGE5Q13069 117 aa17.06■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 GAGE13Q4V321 117 aa17.06■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 WFDC10BQ8IUB3 73 aa17.06■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa17.06■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa17.05■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 Q9UF83 564 aa17.05■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 GTSF1LQ9H1H1 148 aa17.03■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 LY96Q9Y6Y9 160 aa17.03■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 SRP19P09132 144 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00694P0DN24 101 aa17.02■□□□□ 0.32
CXCL2-201ENST00000296031 F2Z2F3 143 aa17.01■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 BTF3P20290 206 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF56Q15929 161 aa17.01■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 SMIM7Q9BQ49 75 aa17.01■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa17■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1B0GVY2 172 aa17■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 RAB4BP61018 213 aa17■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 OR10J3Q5JRS4 329 aa17■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 AP1S3Q96PC3 154 aa17■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa16.99■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa16.99■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 DNAH10OSP0CZ25 163 aa16.99■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00315P59091 139 aa16.99■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 CACNG7P62955 275 aa16.99■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 LELP1Q5T871 98 aa16.99■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF727A8MUV8 499 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 K7EP13 123 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 SMIM17P0DL12 118 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 EVI2AP22794 236 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 TNP2Q05952 138 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 LYZL1Q6UWQ5 148 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 MSRB1Q9NZV6 116 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 FAM231DQ6ZW35 169 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 F5H697 171 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 PKD1P98161 4303 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL2-201ENST00000296031 GATCO43716 136 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 CTRLP40313 264 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 LINC01551Q86U37 167 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 ERVFC1-1P60608 527 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 WDR73Q6P4I2 378 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 A0A087WWC5 75 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 C9JQL5 133 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 NTF3P20783 257 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 PEA15Q15121 130 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 LINC01556Q5JQF7 62 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 OR10G8Q8NGN5 311 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 MGPP08493 103 aa16.92■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 UBE2D3P61077 147 aa16.92■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 UBE2D2P62837 147 aa16.92■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 FAM74A3Q4VXF1 159 aa16.92■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 GTSF1Q8WW33 167 aa16.92■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 SMDT1Q9H4I9 107 aa16.92■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 TRGC1P0CF51 173 aa16.91■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 C10orf126Q8N4M7 172 aa16.91■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa16.91■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 CNFNQ9BYD5 112 aa16.91■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 A8MWL6 223 aa16.9■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV3-30P01768 117 aa16.9■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV3-33P01772 117 aa16.9■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa16.9■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa16.9■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM241Q24JQ0 296 aa16.9■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 CT83Q5H943 113 aa16.9■□□□□ 0.3
CXCL2-201ENST00000296031 TWIST1Q15672 202 aa16.89■□□□□ 0.29
CXCL2-201ENST00000296031 NFE4Q86UQ8 179 aa16.89■□□□□ 0.29
CXCL2-201ENST00000296031 PKHD1P08F94 4074 aa16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms