RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276105.3

SNX12-201, Transcript of sorting nexin 12, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC

Gene SNX12, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12-201ENST00000276105 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 ZNF575Q86XF7 245 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 SYT8Q8NBV8 401 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 TPPP3Q9BW30 176 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 PRO0255Q9UI72 69 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.99□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 C16orf90A8MZG2 172 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 M0R2P5 195 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 PPP1R2P9O14990 202 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 PAX4O43316 350 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 CDK2AP2O75956 126 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 MT-ND4LP03901 98 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 GZMBP10144 247 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 DNLZQ5SXM8 178 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 BORCS7Q96B45 105 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 IL36BQ9NZH7 164 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.98□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 ADCYAP1P18509 176 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 SSTP61278 116 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 ZNF876PQ49A33 203 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 C9orf85Q96MD7 179 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.97□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 PKD1P98161 4303 aa6.96□□□□□ -1.29
SNX12-201ENST00000276105 F2Z2F3 143 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 K7EP13 123 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 M0R381 172 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SIVA1O15304 175 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 APOC3P02656 99 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 CRYBA4P53673 196 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 CT83Q5H943 113 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 ZFP82Q8N141 532 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 RASL10AQ92737 203 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 OR5AL1P0C617 328 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 CACNG7P62955 275 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 FHL2Q14192 279 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SVBPQ8N300 66 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 TSKUQ8WUA8 353 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 PTH2Q96A98 100 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 V9GYV3 84 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 FAM231BA6NCW3 169 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 A8MWV9 139 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SNAI2O43623 268 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SNAPINO95295 136 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 IGHV3-53P01767 116 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 IGLC6P0CF74 106 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 TWIST1Q15672 202 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 NXPH4O95158 308 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SMIM17P0DL12 118 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 LINC00315P59091 139 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 RHEBQ15382 184 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 WDR73Q6P4I2 378 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 NFE4Q86UQ8 179 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 GTSF1Q8WW33 167 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 HIGD1CA8MV81 97 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 RS1O15537 224 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 CIDEAO60543 219 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 TRGC1P0CF51 173 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 NTF3P20783 257 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 S100PP25815 95 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 SRIP30626 198 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 CTRLP40313 264 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 RIGQ13278 110 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX12-201ENST00000276105 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms