RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SRIP30626 198 aa15.29■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 RPS20P60866 119 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 RHOHQ15669 191 aa15.29■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 LY96Q9Y6Y9 160 aa15.29■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa15.27■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.27■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 PRADC1Q9BSG0 188 aa15.27■□□□□ 0.04
SYF2-201ENST00000236273 RHODO00212 210 aa15.26■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 LINC00694P0DN24 101 aa15.26■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 FAM74A4Q5TZK3 123 aa15.26■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 FAM231DQ6ZW35 169 aa15.26■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 LINC01551Q86U37 167 aa15.26■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15.26■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa15.26■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa15.26■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 ZNF727A8MUV8 499 aa15.25■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 RTL8CO15255 209 aa15.25■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 SSTP61278 116 aa15.25■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 IFITM2Q01629 132 aa15.25■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 SPANXN1Q5VSR9 72 aa15.25■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 MSRB1Q9NZV6 116 aa15.25■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 LINC00315P59091 139 aa15.24■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 LYZL1Q6UWQ5 148 aa15.24■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 XKRY2A2RUG3 117 aa15.23■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 TIRAPP58753 221 aa15.23■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 PEA15Q15121 130 aa15.23■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.23■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 SMDT1Q9H4I9 107 aa15.23■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 GTSF1Q8WW33 167 aa15.22■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 TPPP3Q9BW30 176 aa15.22■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPQ1 181 aa15.21■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 F2Z2F3 143 aa15.21■□□□□ 0.03
SYF2-201ENST00000236273 GAGE12JA6NER3 117 aa15.2■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 SIVA1O15304 175 aa15.2■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 GATCO43716 136 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 CTRLP40313 264 aa15.2■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 GAGE1Q13065 139 aa15.2■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 GAGE4Q13068 117 aa15.2■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 GAGE5Q13069 117 aa15.2■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 GAGE13Q4V321 117 aa15.2■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 CNFNQ9BYD5 112 aa15.2■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 RAB4BP61018 213 aa15.19■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 CACNG7P62955 275 aa15.19■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 FAM74A3Q4VXF1 159 aa15.19■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 WDR73Q6P4I2 378 aa15.19■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.19■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa15.19■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 NTF3P20783 257 aa15.18■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 ERVFC1-1P60608 527 aa15.18■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 RPL23P62829 140 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 TMEM241Q24JQ0 296 aa15.18■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 PKD1P98161 4303 aa15.18■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 C1orf134Q5TEV5 83 aa15.17■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 ISOC2Q96AB3 205 aa15.17■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 GTSF1LQ9H1H1 148 aa15.17■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 OSTCQ9NRP0 149 aa15.17■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 BIRC6Q9NR09 4857 aa15.17■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa15.17■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 CT83Q5H943 113 aa15.17■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 CLLU1Q5K131 121 aa15.17■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 AP1S3Q96PC3 154 aa15.17■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 DNAH11Q96DT5 4516 aa15.16■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 EVI2AP22794 236 aa15.16■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 OR10G8Q8NGN5 311 aa15.16■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa15.15■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 A8MWL6 223 aa15.15■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 RAB14P61106 215 aa15.15■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 ZNF56Q15929 161 aa15.15■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 NAT8Q9UHE5 227 aa15.15■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 V9GYV3 84 aa15.15■□□□□ 0.02
SYF2-201ENST00000236273 DNAH10OSP0CZ25 163 aa15.14■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 TTC32Q5I0X7 151 aa15.14■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 LELP1Q5T871 98 aa15.14■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 LINC00336Q6ZUF6 198 aa15.14■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 C6orf223Q8N319 242 aa15.14■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa15.14■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 UBE2D3P61077 147 aa15.13■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 UBE2D2P62837 147 aa15.13■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 SOHLH1Q5JUK2 328 aa15.13■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa15.12■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GVY2 172 aa15.12■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 F5H697 171 aa15.12■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 SMIM17P0DL12 118 aa15.12■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 TSKUQ8WUA8 353 aa15.12■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.12■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 M0QY20 66 aa15.11■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 TWIST1Q15672 202 aa15.11■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 ADIRFQ15847 76 aa15.11■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.1■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 TRGC1P0CF51 173 aa15.1■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.1■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa15.09■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 FAM231BA6NCW3 169 aa15.09■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 OR10J3Q5JRS4 329 aa15.09■□□□□ 0.01
SYF2-201ENST00000236273 SUMO4Q6EEV6 95 aa15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms