RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dmrtc1c1Q9D410 238 aa9.4□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnase4Q9JJH1 148 aa9.4□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Epg5Q80TA9 2572 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mmp27D3YV89 551 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm8653K9J7G2 307 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r117L7N2C9 307 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wnt10aP70701 417 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bst1Q64277 311 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifna14Q810G3 189 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sox21Q811W0 276 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prok1Q14A28 105 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pitpnc1Q8K4R4 332 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 4933414I15RikQ9D4D5 133 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col13a1Q9R1N9 751 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ovol1Q9WTJ2 267 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Frrs1lB1AXV0 293 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il22ra2Q80XF5 230 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr3kQ9CQZ7 108 aa9.39□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Coq2Q66JT7 374 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmed3Q78IS1 221 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nkg7Q99PA5 165 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem29A2ANF5 204 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serf2P84102 59 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arrdc5Q497K5 325 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc37a1Q8R070 531 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr958Q8VEY3 312 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1086Q8VFL9 310 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp119aQ9JIC0 545 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Try5Q9QUK9 246 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Try4Q9R0T7 246 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1291-ps1A0A286YE47 326 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm17455G3UW87 128 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd200r4Q6XJV4 270 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam206aQ80ZQ9 193 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9949Q8C9F4 104 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr211Q8VGH2 309 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 GgactQ923B0 149 aa9.38□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm20767O70517 169 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ucp1P12242 307 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Asphd2Q80VP9 343 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Parp11Q8CFF0 331 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rgs13Q8K443 158 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r225Q8R2A5 298 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1294Q8VGE5 312 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srp19Q9D7A6 144 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnd2Q9QYM5 227 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rab9aQ9R0M6 201 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-55A0A075B5W6 117 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav17A0A075B655 113 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7697A0A0J9YUH2 350 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9495A0A0J9YUZ3 350 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm14412A2ARR7 526 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01788 123 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Csn1s2bP02664 143 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 9230109A22RikQ8BHE6 111 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Commd9Q8K2Q0 198 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r66Q8K4I0 310 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav13n-4A0A0G2JG01 110 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp708F8VPP0 541 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gata2O09100 480 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adrb3P25962 400 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gsx1P31315 261 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1173Q7TR24 312 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr335-psQ7TRY6 312 aa9.37□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm17660B9UIU9 90 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r160E9Q346 307 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r123L7N270 307 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Csn2P10598 231 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp970Q08BU3 522 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc2a9Q3T9X0 538 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nbl1Q61477 178 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1042Q7TR81 313 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 AmtQ8CFA2 403 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 HaghQ99KB8 309 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 SvbpQ99LQ4 66 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fgf16Q9ESL8 207 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wnk1P83741 2377 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nav3Q80TN7 2359 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trbv31A0A075B5J5 111 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01643 108 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01790 122 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cfc1P97766 202 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sf3a2Q62203 475 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdpf1Q8R3A2 119 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1258Q8VGN6 311 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnip2Q9JJ69 270 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpa33Q9JKA5 319 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prss1Q9Z1R9 246 aa9.36□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-19A0A0A6YWX0 117 aa9.35□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-69A0A0G2JFS5 117 aa9.35□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr282A1L1B4 308 aa9.35□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm21732J3QM79 361 aa9.35□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm21921J3QNB5 361 aa9.35□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sult2a1P52843 285 aa9.35□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a31Q3V132 320 aa9.35□□□□□ -0.91
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psg27Q497W2 474 aa9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54 ms