RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		H7C423	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	DNAL4	O96015	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A087WZ39	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	WNT9B	O14905	357 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	CCL13	Q99616	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	NXPH4	O95158	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		H0Y9J4	135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	CD52	P31358	61 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00313	P59037	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TNP2	Q05952	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	BLCAP	P62952	87 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		Q9HAA7	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A0J9YY99	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		Q8N2B8	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	SPINK2	P20155	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		Q86TA4	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A087WVE0	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	ABCA1	O95477	2261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		U3KQK5	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	SH2D1A	O60880	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		P0C879	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2A	P49459	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	PLGLA	Q15195	96 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072		Q75L30	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	XCL1	P47992	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TFF1	P04155	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZS46	218 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00473	A8K010	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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