RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRO1933	Q9H354	126 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL36B	Q9NZH7	164 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576		X6R8D5	127 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIGD1C	A8MV81	97 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576		H3BVH4	76 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPRY2	O43597	315 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASIP	P42127	132 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB4B	P61018	213 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR11H2	Q8NH07	326 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	RETN	Q9HD89	108 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRN3P1	Q2M238	152 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLC6	P0CF74	106 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	CXCL1	P09341	107 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUP35	Q8NFH5	326 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBN3	Q75N90	2809 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM231B	A6NCW3	169 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	PKIA	P61925	76 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUC4	Q99102	2169 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PPQ1	181 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPINK4	O60575	86 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	G0S2	P27469	103 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	IMMP2L	Q96T52	175 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5AL1	P0C617	328 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	FABP4	P15090	132 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	EMP1	P54849	157 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF415	Q09FC8	603 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	C9orf85	Q96MD7	179 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEFB4A	O15263	64 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNAI2	O43623	268 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTRL	P40313	264 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	C16orf74	Q96GX8	76 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576		F2Z2F3	143 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRGC2	P03986	189 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576		M0R381	172 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELOB	Q15370	118 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q8NAQ8	132 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNURFL	B1AK76	121 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSTD3	H0UI37	97 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	MED14OS	P0DP75	135 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIF	P14174	115 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	YPEL4	Q96NS1	127 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	B9D2	Q9BPU9	175 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA25	Q9BR10	227 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNFN	Q9BYD5	112 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GUT8	65 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	NTF3	P20783	257 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL17D	Q8TAD2	202 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	BTF3L4	Q96K17	158 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	EREG	O14944	169 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF876P	Q49A33	203 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHOX2A	O14813	284 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	TWIST1	Q15672	202 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	BORCS7	Q96B45	105 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM210B	Q96KR6	192 aa		6.56	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms