RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	USMG5	Q96IX5	58 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	C20orf173	Q96LM9	149 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	CACNA1A	O00555	2505 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377		A6NDX4	124 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	FOXI1	Q12951	378 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377		H3BUA1	57 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	PF4V1	P10720	104 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	BLCAP	P62952	87 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	C12orf74	Q32Q52	190 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	KLK15	Q9H2R5	256 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8	3e-8	■■■■□ 21.2
CSNK1D-222	ENST00000584377	BRI3	O95415	125 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRR9	Q5T870	116 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377		Q6ZUT4	128 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	LINC01546	A6NGU7	62 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	LEP	P41159	167 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	XG	P55808	180 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	10.04	□□□□□ -0.8	4e-10	■■■■■ 31.5
CSNK1D-222	ENST00000584377	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377		Q6ZS46	218 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377		J3KRW8	73 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	SOCS3	O14543	225 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	FHL3	Q13643	280 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZMAT4	Q9H898	229 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377		H3BVH4	76 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	FCER1G	P30273	86 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	ODF1	Q14990	250 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	RRN3P1	Q2M238	152 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	OVOL1	O14753	267 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377		B4DSR2	109 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	AVP	P01185	164 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	DEFB1	P60022	68 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	GAGE5	Q13069	117 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	GAGE6	Q13070	117 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	NFE4	Q86UQ8	179 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377		Q8N8P6	123 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGLV1-40	P01703	118 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGKC	P01834	107 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377		B5MCH6	92 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRSS1	P07477	247 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	TAL2	Q16559	108 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	NRAC	Q8N912	160 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		10	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	NRGN	Q92686	78 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	ACACB	O00763	2458 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377		F6UB75	175 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	HIST1H4G	Q99525	98 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	CFHR3	Q02985	330 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377		M0R381	172 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	HLA-DRB4	P13762	266 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	ASIP	P42127	132 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	HERV-K104	P63124	156 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	LAGE3	Q14657	143 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		9.96	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	DPM2	O94777	84 aa		9.96	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	DSCR9	P59020	149 aa		9.96	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		9.96	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		9.96	□□□□□ -0.81
CSNK1D-222	ENST00000584377	FOXC2	Q99958	501 aa		9.96	□□□□□ -0.81

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