RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577315.5

MKS1-205, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKS1, Length 495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-205ENST00000577315 FABP5P3A8MUU1 101 aa10.09□□□□□ -0.79
MKS1-205ENST00000577315 IFNA7P01567 189 aa10.09□□□□□ -0.79
MKS1-205ENST00000577315 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
MKS1-205ENST00000577315 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
MKS1-205ENST00000577315 OR10J3Q5JRS4 329 aa10.09□□□□□ -0.79
MKS1-205ENST00000577315 ZNF506Q5JVG8 444 aa10.09□□□□□ -0.79
MKS1-205ENST00000577315 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.09□□□□□ -0.79
MKS1-205ENST00000577315 HIST1H2BAQ96A08 127 aa10.09□□□□□ -0.79
MKS1-205ENST00000577315 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.08□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 A8MWV9 139 aa10.08□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 LELP1Q5T871 98 aa10.08□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 DPPA3Q6W0C5 159 aa10.08□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.08□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 OR2T35Q8NGX2 323 aa10.08□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.08□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.07□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 PEX7O00628 323 aa10.07□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 PSCAO43653 123 aa10.07□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 ASIPP42127 132 aa10.07□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 ZNF726P1Q15940 193 aa10.07□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa10.07□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 GTSF1LQ9H1H1 148 aa10.07□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.06□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 TCEAL7Q9BRU2 100 aa10.06□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 PARLQ9H300 379 aa10.06□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 IL36BQ9NZH7 164 aa10.06□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 ZFP30Q9Y2G7 519 aa10.06□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.05□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.05□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 FAM74A7A6NL05 159 aa10.05□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 UBE2G2P60604 165 aa10.05□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 DNLZQ5SXM8 178 aa10.05□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.05□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 Q86TA4 180 aa10.05□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 STOML3Q8TAV4 291 aa10.05□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 LINC00479Q96M42 142 aa10.05□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 EPM2AB3EWF7 344 aa10.04□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 GCSHP23434 173 aa10.04□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 UBE2G1P62253 170 aa10.04□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 LAGE3Q14657 143 aa10.04□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 SYT8Q8NBV8 401 aa10.04□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 FMC1Q96HJ9 113 aa10.04□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.03□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 B4DEV8 164 aa10.03□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 RHODO00212 210 aa10.03□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 ARPC5O15511 151 aa10.03□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 FHITP49789 147 aa10.03□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 RGS21Q2M5E4 152 aa10.03□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.03□□□□□ -0.8
MKS1-205ENST00000577315 A0A087WWC5 75 aa10.02□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa10.02□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 FAM162BQ5T6X4 162 aa10.02□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 TM2D2Q9BX73 214 aa10.02□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 KRBOX1C9JBD0 128 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 IGHV3-30P01768 117 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 IGHV3-33P01772 117 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 XGP55808 180 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 KRTAP10-1P60331 282 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 TOR2AQ5JU69 321 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.01□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 LRCOL1A6NCL2 159 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 GAGE12JA6NER3 117 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 G3V3Q6 166 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 H3BVH4 76 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 ARMS2P0C7Q2 107 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 LINC00694P0DN24 101 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 GAGE1Q13065 139 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 GAGE4Q13068 117 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 GAGE5Q13069 117 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 ZNF674Q2M3X9 581 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 GAGE13Q4V321 117 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 FRZBQ92765 325 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 Q9HAA7 133 aa10□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 SH2D1AO60880 128 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 SEC11BP0C7V7 166 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 CRIP1P50238 77 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 ZNF345Q14585 488 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 LINC01559Q495D7 138 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 CST9LP1Q5W188 147 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 Q6ZSN1 163 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 Q8N814 137 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.99□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 UMAD1C9J7I0 102 aa9.98□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 M0R036 132 aa9.98□□□□□ -0.81
MKS1-205ENST00000577315 LTAP01374 205 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms