RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542555.1

CLPB-211, Transcript of ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin, humanhuman

TSL 2

Gene CLPB, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPB-211ENST00000542555 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.15□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 GNRH2O43555 120 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 GAS8-AS1O95177 125 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 CRPP02741 224 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 CAV2P51636 162 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 HBG1P69891 147 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 HBG2P69892 147 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 Q6ZQT7 251 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 ASB13Q8WXK3 278 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 RAB24Q969Q5 203 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 KLK12Q9UKR0 248 aa5.14□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 C9orf170A2RU37 121 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 GAGE12JA6NER3 117 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 SMIM18P0DKX4 95 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 S100A11P31949 105 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 INPP1P49441 399 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 GAGE1Q13065 139 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 GAGE4Q13068 117 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 GAGE5Q13069 117 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 C7orf33Q8WU49 177 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 NMES1Q9C002 83 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.13□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 A0A0U1RQV1 116 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 C7orf66A4D0T2 115 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 TMEM262E9PQX1 116 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 OR7C2O60412 319 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 CST7O76096 145 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 FGF7P21781 194 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 RANP62826 216 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 ARL16Q0P5N6 197 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 CTF1Q16619 201 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 ATP6V1FQ16864 119 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 PYDC2Q56P42 97 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 NIT1Q86X76 327 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 STX12Q86Y82 276 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 TYMSP04818 313 aa5.11□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 NPSP0C0P6 89 aa5.11□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 ODF1Q14990 250 aa5.11□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.11□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 TMED6Q8WW62 240 aa5.11□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 HYLS1Q96M11 299 aa5.11□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 TREM1Q9NP99 234 aa5.11□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 A8MWV9 139 aa5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 TAAR5O14804 337 aa5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 HLA-DQA1P01909 254 aa5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 REG3GQ6UW15 175 aa5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 RNF185Q96GF1 192 aa5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 FAM25EA8MYX2 175 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 USP17L23D6RBM5 183 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 SULT1A1P50225 295 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 TAS2R45P59539 299 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 PKIAP61925 76 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 ZFP69Q49AA0 526 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 C10orf25Q5T742 122 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 PTH2Q96A98 100 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 LINC01600Q96MT4 127 aa5.09□□□□□ -1.59
CLPB-211ENST00000542555 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.08□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 CENPXA8MT69 81 aa5.08□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 F6UZH7 168 aa5.08□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 K7EQM0 130 aa5.08□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 S100A10P60903 97 aa5.08□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.08□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.08□□□□□ -1.6
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