RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		7.66	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	KCNS1	Q96KK3	526 aa		7.66	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087WYN8	130 aa		7.65	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	PGP	A6NDG6	321 aa		7.65	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	OR7C2	O60412	319 aa		7.65	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	GNG5	P63218	68 aa		7.65	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		7.65	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		7.65	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		7.65	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		7.65	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0J9YXV3	536 aa		7.64	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	FAM25E	A8MYX2	175 aa		7.64	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	PHOX2A	O14813	284 aa		7.64	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	SLPI	P03973	132 aa		7.64	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	RAB32	Q13637	225 aa		7.64	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		7.64	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		7.64	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	ATP5S	Q99766	215 aa		7.64	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		7.64	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087WX48	190 aa		7.63	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557		H3BMQ9	156 aa		7.63	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V1F	Q16864	119 aa		7.63	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		7.63	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		7.63	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	NMES1	Q9C002	83 aa		7.63	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	OTOR	Q9NRC9	128 aa		7.63	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		7.63	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		7.62	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	HLA-DQA1	P01909	254 aa		7.62	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	TMBIM6	P55061	237 aa		7.62	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557		Q0VG73	95 aa		7.62	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	MPV17L2	Q567V2	206 aa		7.62	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		7.62	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		7.62	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	S100A10	P60903	97 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	HBG1	P69891	147 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	HBG2	P69892	147 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	ELOB	Q15370	118 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	MBD2	Q9UBB5	411 aa		7.61	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		7.6	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		7.6	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557		A8MWV9	139 aa		7.6	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	GCG	P01275	180 aa		7.6	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	STX12	Q86Y82	276 aa		7.6	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		7.6	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		7.6	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM262	E9PQX1	116 aa		7.59	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	TAAR5	O14804	337 aa		7.59	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	WDR73	Q6P4I2	378 aa		7.59	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		7.59	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		7.59	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		7.59	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	DPH3	Q96FX2	82 aa		7.59	□□□□□ -1.19
BBS1-222	ENST00000533557	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2D3	P61077	147 aa		7.58	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2D2	P62837	147 aa		7.58	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		7.58	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		7.58	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087WWL8	130 aa		7.57	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557		H0YIZ8	118 aa		7.57	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		7.57	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	PRR34	Q9NV39	138 aa		7.57	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	PSG8	Q9UQ74	426 aa		7.57	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	PLA2G10	O15496	165 aa		7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	CRP	P02741	224 aa		7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	KHDC3L	Q587J8	217 aa		7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	RNF185	Q96GF1	192 aa		7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	BATF3	Q9NR55	127 aa		7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		7.56	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	TCRA	P04437	139 aa		7.55	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	MIA	Q16674	131 aa		7.55	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.55	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		7.54	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		7.54	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557		H3BVH4	76 aa		7.54	□□□□□ -1.2
BBS1-222	ENST00000533557	TRIQK	Q629K1	86 aa		7.54	□□□□□ -1.2

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